More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0251 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0251  xanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 190 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6072  xanthine phosphoribosyltransferase  83.68 
 
 		 190 aa  317  6e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69940  xanthine phosphoribosyltransferase  83.68 
 
 		 190 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5265  xanthine phosphoribosyltransferase  74.21 
 
 		 190 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5317  xanthine phosphoribosyltransferase  74.21 
 
 		 190 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0748508  normal  0.105571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5175  xanthine phosphoribosyltransferase  74.21 
 
 		 190 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458979  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0205  xanthine phosphoribosyltransferase  73.16 
 
 		 190 aa  281  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5520  xanthine phosphoribosyltransferase  72.11 
 
 		 190 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0076  xanthine phosphoribosyltransferase  72.34 
 
 		 189 aa  273  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0112  xanthine phosphoribosyltransferase  72.34 
 
 		 189 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  64.21 
 
 		 190 aa  256  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1697  xanthine phosphoribosyltransferase  63.49 
 
 		 197 aa  246  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3719  xanthine phosphoribosyltransferase  63.49 
 
 		 197 aa  245  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1490  xanthine phosphoribosyltransferase  62.96 
 
 		 197 aa  244  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1626  xanthine phosphoribosyltransferase  62.96 
 
 		 197 aa  244  4e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1475  xanthine phosphoribosyltransferase  62.96 
 
 		 197 aa  244  6e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0761652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  62.96 
 
 		 197 aa  244  6e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1591  xanthine phosphoribosyltransferase  62.96 
 
 		 197 aa  244  6e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.556835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1661  xanthine phosphoribosyltransferase  62.96 
 
 		 197 aa  244  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.855078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1737  xanthine phosphoribosyltransferase  62.96 
 
 		 197 aa  244  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000180349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1448  xanthine phosphoribosyltransferase  62.96 
 
 		 197 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000584742  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1302  xanthine phosphoribosyltransferase  63.49 
 
 		 197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.550156  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 		 191 aa  223  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0902677  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1086  xanthine phosphoribosyltransferase  57.98 
 
 		 193 aa  221  4e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.821507  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0537  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  55.14 
 
 		 206 aa  211  3.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0798782  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2387  xanthine phosphoribosyltransferase  54.21 
 
 		 195 aa  210  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0720  xanthine phosphoribosyltransferase  53.16 
 
 		 196 aa  205  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000414905  normal  0.141539 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2755  xanthine phosphoribosyltransferase  51.32 
 
 		 190 aa  204  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1265  xanthine phosphoribosyltransferase  52.66 
 
 		 197 aa  202  3e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.165454  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0067  xanthine phosphoribosyltransferase  51.32 
 
 		 192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00414676  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0435  xanthine phosphoribosyltransferase  51.32 
 
 		 192 aa  198  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.584524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0446  xanthine phosphoribosyltransferase  51.32 
 
 		 192 aa  198  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210484  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2059  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  55.56 
 
 		 189 aa  198  5e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1405  xanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0380  xanthine phosphoribosyltransferase  52.22 
 
 		 192 aa  192  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000351735  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2147  xanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 193 aa  192  3e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0319  xanthine phosphoribosyltransferase  51.32 
 
 		 190 aa  192  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0313  xanthine phosphoribosyltransferase  51.32 
 
 		 190 aa  192  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0628  xanthine phosphoribosyltransferase  51.31 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00387933  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0364  xanthine phosphoribosyltransferase  50.79 
 
 		 193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0229  xanthine phosphoribosyltransferase  46.56 
 
 		 192 aa  179  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115581  hitchhiker  6.642120000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2173  xanthine phosphoribosyltransferase  47.03 
 
 		 188 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0867075  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2968  xanthine phosphoribosyltransferase  48.42 
 
 		 191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1498  xanthine phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00482653  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1287  xanthine phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11335  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3381  xanthine phosphoribosyltransferase  46.84 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00123669  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17850  xanthine phosphoribosyltransferase  45.55 
 
 		 192 aa  162  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2510  xanthine phosphoribosyltransferase  37.63 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0705495  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0491  xanthine phosphoribosyltransferase  39.89 
 
 		 202 aa  127  9.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46613  predicted protein  33.16 
 
 		 798 aa  121  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2135  xanthine phosphoribosyltransferase  40.22 
 
 		 204 aa  117  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2627  pur operon repressor  32.8 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0089  pur operon repressor  29.88 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0058  pur operon repressor  30.77 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0040  pur operon repressor  30.4 
 
 		 273 aa  68.6  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0041  pur operon repressor  30.3 
 
 		 282 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0051  pur operon repressor  30.3 
 
 		 282 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0044  pur operon repressor  30.3 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0041  pur operon repressor  30.3 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  33.7 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3095  pur operon repressor  29.6 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.933063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0051  pur operon repressor  30.3 
 
 		 282 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000444912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0041  pur operon repressor  31.06 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5265  pur operon repressor  30.3 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.549004  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0045  pur operon repressor  30.3 
 
 		 282 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0041  pur operon repressor  30.3 
 
 		 282 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0055  pur operon repressor  30.3 
 
 		 282 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.748352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0044  pur operon repressor  30.3 
 
 		 282 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21340  pur operon repressor  27.81 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0042  pur operon repressor  28.8 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00214648  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0584  pur operon repressor  28.24 
 
 		 274 aa  64.7  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0134  pur operon repressor  28 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000199065  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1847  adenine phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.820811  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0837  phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0530  pur operon repressor  28 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000100819  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0517  pur operon repressor  28 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00109684  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  34.09 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1118  adenine phosphoribosyltransferase  31.87 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0210  pur operon repressor  26.77 
 
 		 278 aa  61.6  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000033257  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2501  pur operon repressor  26.52 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1150  adenine phosphoribosyltransferase  24.69 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0772  phosphoribosyltransferase  28.97 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.15147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  33.58 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2815  pur operon repressor  26.52 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1435  adenine phosphoribosyltransferase  26.17 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  31.11 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0755  Adenine phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  30.82 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2871  adenine phosphoribosyltransferase  27.47 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.277203 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  35.4 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0805  adenine phosphoribosyltransferase  24.07 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.129708  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  32 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1530  adenine phosphoribosyltransferase  24.84 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>