More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0210 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0210  pur operon repressor  100 
 
 
278 aa  569  1e-161  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000033257  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0219  pur operon repressor  50.92 
 
 
281 aa  290  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000738086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0042  pur operon repressor  52.42 
 
 
274 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00214648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0044  pur operon repressor  49.81 
 
 
282 aa  285  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5265  pur operon repressor  49.44 
 
 
282 aa  285  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.549004  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0041  pur operon repressor  49.44 
 
 
282 aa  285  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0045  pur operon repressor  49.44 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0041  pur operon repressor  49.44 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0051  pur operon repressor  49.44 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000444912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0044  pur operon repressor  49.44 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0055  pur operon repressor  49.44 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0041  pur operon repressor  49.06 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1608  pur operon repressor  51.67 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0041  pur operon repressor  49.44 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0051  pur operon repressor  49.44 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0040  pur operon repressor  52.06 
 
 
273 aa  277  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1543  pur operon repressor  50.75 
 
 
284 aa  276  3e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0134  pur operon repressor  46.47 
 
 
274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000199065  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0517  pur operon repressor  46.47 
 
 
274 aa  269  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00109684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0530  pur operon repressor  46.47 
 
 
274 aa  269  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000100819  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2590  pur operon repressor  47.39 
 
 
271 aa  269  2.9999999999999997e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1772  pur operon repressor  47.96 
 
 
270 aa  259  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1765  pur operon repressor  46.13 
 
 
274 aa  259  4e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.011589  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21340  pur operon repressor  43.23 
 
 
271 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0089  pur operon repressor  44.94 
 
 
278 aa  236  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2501  pur operon repressor  41.34 
 
 
267 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2815  pur operon repressor  40.94 
 
 
267 aa  225  7e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0584  pur operon repressor  40.07 
 
 
274 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0175  pur operon repressor  40.53 
 
 
275 aa  223  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0230472  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3095  pur operon repressor  38.49 
 
 
270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.933063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2627  pur operon repressor  38.93 
 
 
272 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2400  pur operon repressor  37.84 
 
 
272 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0058  pur operon repressor  35.96 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0772  phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 
264 aa  149  5e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.15147  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1265  xanthine phosphoribosyltransferase  28.25 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.165454  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0537  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  25.99 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0798782  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46613  predicted protein  25 
 
 
798 aa  69.7  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0380  xanthine phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000351735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1697  xanthine phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 
197 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1086  xanthine phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 
193 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.821507  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1475  xanthine phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 
197 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0761652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 
197 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1448  xanthine phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 
197 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000584742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1737  xanthine phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 
197 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000180349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1591  xanthine phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 
197 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.556835  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3719  xanthine phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 
197 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1661  xanthine phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 
197 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.855078 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1490  xanthine phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 
197 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 
190 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3381  xanthine phosphoribosyltransferase  26.75 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00123669  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  27.81 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1626  xanthine phosphoribosyltransferase  25.81 
 
 
197 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0319  xanthine phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0313  xanthine phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2755  xanthine phosphoribosyltransferase  27.51 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  24.05 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0902677  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0628  xanthine phosphoribosyltransferase  26.42 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00387933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1302  xanthine phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 
197 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
181 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  27.74 
 
 
180 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1473  adenine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
176 aa  65.1  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 
180 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6072  xanthine phosphoribosyltransferase  25.98 
 
 
190 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3489  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
180 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0169872 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2387  xanthine phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 
195 aa  63.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2968  xanthine phosphoribosyltransferase  30.58 
 
 
191 aa  63.5  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17850  xanthine phosphoribosyltransferase  28.8 
 
 
192 aa  63.2  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2173  xanthine phosphoribosyltransferase  26.8 
 
 
188 aa  62.4  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0867075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0076  xanthine phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 
189 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287774  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69940  xanthine phosphoribosyltransferase  25.2 
 
 
190 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0251  xanthine phosphoribosyltransferase  26.77 
 
 
190 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0545  adenine phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 
173 aa  60.8  0.00000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.342183  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  29.22 
 
 
172 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0112  xanthine phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 
189 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0205  xanthine phosphoribosyltransferase  27.81 
 
 
190 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605547 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  25.31 
 
 
171 aa  59.7  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 
171 aa  59.7  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  26.97 
 
 
181 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0491  xanthine phosphoribosyltransferase  26.58 
 
 
202 aa  59.3  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5265  xanthine phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 
190 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4542  adenine phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 
170 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5175  xanthine phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 
190 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458979  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4492  adenine phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 
170 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4303  adenine phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 
170 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4141  adenine phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 
170 aa  58.9  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4488  adenine phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 
170 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5317  xanthine phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 
190 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0748508  normal  0.105571 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4638  adenine phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 
170 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
172 aa  59.3  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1498  xanthine phosphoribosyltransferase  21.88 
 
 
192 aa  58.9  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00482653  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1287  xanthine phosphoribosyltransferase  21.88 
 
 
192 aa  58.9  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4527  adenine phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 
170 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4152  adenine phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 
170 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5520  xanthine phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 
190 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0708  adenine phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 
170 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
172 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00395  adenine phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
186 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  25.81 
 
 
173 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2059  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  27.07 
 
 
189 aa  58.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 
172 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>