More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5317 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5265  xanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5317  xanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0748508  normal  0.105571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5175  xanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458979  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0205  xanthine phosphoribosyltransferase  97.89 
 
 		 190 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605547 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5520  xanthine phosphoribosyltransferase  90.53 
 
 		 190 aa  351  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0112  xanthine phosphoribosyltransferase  90.96 
 
 		 189 aa  349  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0076  xanthine phosphoribosyltransferase  91.49 
 
 		 189 aa  348  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0251  xanthine phosphoribosyltransferase  74.21 
 
 		 190 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6072  xanthine phosphoribosyltransferase  73.16 
 
 		 190 aa  280  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69940  xanthine phosphoribosyltransferase  73.16 
 
 		 190 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  65.79 
 
 		 190 aa  261  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1697  xanthine phosphoribosyltransferase  62.11 
 
 		 197 aa  244  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1448  xanthine phosphoribosyltransferase  62.11 
 
 		 197 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000584742  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1302  xanthine phosphoribosyltransferase  62.11 
 
 		 197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.550156  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1490  xanthine phosphoribosyltransferase  61.05 
 
 		 197 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3719  xanthine phosphoribosyltransferase  61.58 
 
 		 197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1626  xanthine phosphoribosyltransferase  61.05 
 
 		 197 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1475  xanthine phosphoribosyltransferase  61.58 
 
 		 197 aa  242  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0761652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  61.58 
 
 		 197 aa  242  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1591  xanthine phosphoribosyltransferase  61.58 
 
 		 197 aa  242  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.556835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1661  xanthine phosphoribosyltransferase  61.58 
 
 		 197 aa  242  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.855078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1737  xanthine phosphoribosyltransferase  61.58 
 
 		 197 aa  242  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000180349  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  60 
 
 		 191 aa  241  6e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0902677  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0537  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  56.91 
 
 		 206 aa  217  7.999999999999999e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0798782  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1086  xanthine phosphoribosyltransferase  57.37 
 
 		 193 aa  214  5.9999999999999996e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.821507  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2059  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  57.67 
 
 		 189 aa  210  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0720  xanthine phosphoribosyltransferase  54.5 
 
 		 196 aa  204  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000414905  normal  0.141539 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2387  xanthine phosphoribosyltransferase  53.19 
 
 		 195 aa  202  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0067  xanthine phosphoribosyltransferase  50.79 
 
 		 192 aa  201  7e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00414676  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2755  xanthine phosphoribosyltransferase  51.05 
 
 		 190 aa  200  8e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2147  xanthine phosphoribosyltransferase  51.34 
 
 		 193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0446  xanthine phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 		 192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210484  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0435  xanthine phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 		 192 aa  199  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.584524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1265  xanthine phosphoribosyltransferase  51.6 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.165454  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0380  xanthine phosphoribosyltransferase  50.56 
 
 		 192 aa  191  5e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000351735  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2968  xanthine phosphoribosyltransferase  51.58 
 
 		 191 aa  188  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0229  xanthine phosphoribosyltransferase  47.09 
 
 		 192 aa  183  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115581  hitchhiker  6.642120000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0628  xanthine phosphoribosyltransferase  50.79 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00387933  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1405  xanthine phosphoribosyltransferase  47.89 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0364  xanthine phosphoribosyltransferase  50.79 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2173  xanthine phosphoribosyltransferase  49.17 
 
 		 188 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0867075  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0319  xanthine phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 		 190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0313  xanthine phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 		 190 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3381  xanthine phosphoribosyltransferase  47.89 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00123669  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1498  xanthine phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00482653  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1287  xanthine phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 		 192 aa  163  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11335  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17850  xanthine phosphoribosyltransferase  44.81 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0491  xanthine phosphoribosyltransferase  46.56 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2510  xanthine phosphoribosyltransferase  35.83 
 
 		 200 aa  131  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0705495  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46613  predicted protein  34.22 
 
 		 798 aa  123  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2135  xanthine phosphoribosyltransferase  39.34 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0058  pur operon repressor  28.3 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0040  pur operon repressor  30.4 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0089  pur operon repressor  31.2 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2627  pur operon repressor  31.2 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21340  pur operon repressor  29.6 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0041  pur operon repressor  29.13 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0051  pur operon repressor  29.13 
 
 		 282 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0042  pur operon repressor  28 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00214648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5265  pur operon repressor  29.13 
 
 		 282 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.549004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  31.52 
 
 		 214 aa  62  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0041  pur operon repressor  29.92 
 
 		 282 aa  62  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0041  pur operon repressor  29.13 
 
 		 282 aa  62  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  29.31 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0044  pur operon repressor  29.13 
 
 		 282 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0045  pur operon repressor  29.13 
 
 		 282 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0051  pur operon repressor  29.13 
 
 		 282 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000444912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0041  pur operon repressor  29.13 
 
 		 282 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0044  pur operon repressor  29.13 
 
 		 282 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0055  pur operon repressor  29.13 
 
 		 282 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.748352  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0755  Adenine phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0584  pur operon repressor  28.46 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0210  pur operon repressor  27.15 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000033257  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1150  adenine phosphoribosyltransferase  25.64 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1847  adenine phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.820811  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  33.56 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  31.75 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1435  adenine phosphoribosyltransferase  28.26 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1496  adenine phosphoribosyltransferase  28.66 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0805  adenine phosphoribosyltransferase  25 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.129708  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1530  adenine phosphoribosyltransferase  25.64 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  30.94 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>