255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0134 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0134  pur operon repressor  100 
 
 
274 aa  551  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000199065  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0517  pur operon repressor  94.89 
 
 
274 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00109684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0530  pur operon repressor  94.89 
 
 
274 aa  525  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000100819  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0042  pur operon repressor  57.84 
 
 
274 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00214648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5265  pur operon repressor  54.01 
 
 
282 aa  316  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.549004  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0051  pur operon repressor  54.01 
 
 
282 aa  316  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000444912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0044  pur operon repressor  54.01 
 
 
282 aa  316  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0041  pur operon repressor  53.65 
 
 
282 aa  315  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0051  pur operon repressor  53.65 
 
 
282 aa  315  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0045  pur operon repressor  53.65 
 
 
282 aa  314  8e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0041  pur operon repressor  53.65 
 
 
282 aa  314  8e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0055  pur operon repressor  53.65 
 
 
282 aa  314  8e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.748352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0044  pur operon repressor  53.65 
 
 
282 aa  314  8e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0040  pur operon repressor  56.34 
 
 
273 aa  314  8e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0041  pur operon repressor  52.92 
 
 
282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0041  pur operon repressor  53.28 
 
 
282 aa  310  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1765  pur operon repressor  52.21 
 
 
274 aa  295  7e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.011589  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1772  pur operon repressor  50 
 
 
270 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0210  pur operon repressor  46.47 
 
 
278 aa  272  3e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000033257  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1608  pur operon repressor  47.06 
 
 
277 aa  272  5.000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2590  pur operon repressor  46.04 
 
 
271 aa  261  6e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0219  pur operon repressor  44.98 
 
 
281 aa  261  8.999999999999999e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000738086  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1543  pur operon repressor  46.1 
 
 
284 aa  261  1e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21340  pur operon repressor  44.74 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0584  pur operon repressor  42.97 
 
 
274 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0089  pur operon repressor  42.86 
 
 
278 aa  235  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3095  pur operon repressor  39.85 
 
 
270 aa  229  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.933063  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0058  pur operon repressor  40.62 
 
 
280 aa  218  1e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2627  pur operon repressor  36.98 
 
 
272 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2815  pur operon repressor  37.89 
 
 
267 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2501  pur operon repressor  37.89 
 
 
267 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2400  pur operon repressor  38.64 
 
 
272 aa  210  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0175  pur operon repressor  34.22 
 
 
275 aa  190  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0230472  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0772  phosphoribosyltransferase  29.18 
 
 
264 aa  160  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.15147  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1265  xanthine phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 
197 aa  74.7  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.165454  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46613  predicted protein  27.33 
 
 
798 aa  72  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  26.06 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0902677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3381  xanthine phosphoribosyltransferase  29.51 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00123669  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0023  phosphoribosyltransferase  27.45 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00393898 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  28 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1302  xanthine phosphoribosyltransferase  30.07 
 
 
197 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.550156  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2147  xanthine phosphoribosyltransferase  23.49 
 
 
193 aa  64.7  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0537  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  25.17 
 
 
206 aa  64.3  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0798782  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2059  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  28.87 
 
 
189 aa  64.3  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2968  xanthine phosphoribosyltransferase  26.02 
 
 
191 aa  63.9  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0251  xanthine phosphoribosyltransferase  28 
 
 
190 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6072  xanthine phosphoribosyltransferase  27.2 
 
 
190 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17850  xanthine phosphoribosyltransferase  26.19 
 
 
192 aa  61.6  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3719  xanthine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
197 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0491  xanthine phosphoribosyltransferase  25.41 
 
 
202 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69940  xanthine phosphoribosyltransferase  27.2 
 
 
190 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1490  xanthine phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 
197 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1785  adenine phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 
248 aa  60.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232267  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0380  xanthine phosphoribosyltransferase  28 
 
 
192 aa  60.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000351735  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1626  xanthine phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
197 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0076  xanthine phosphoribosyltransferase  25.6 
 
 
189 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287774  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2755  xanthine phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 
190 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1475  xanthine phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
197 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0761652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2387  xanthine phosphoribosyltransferase  25.26 
 
 
195 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
197 aa  59.7  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1737  xanthine phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
197 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000180349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1591  xanthine phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
197 aa  59.7  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.556835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1661  xanthine phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
197 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.855078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1697  xanthine phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
197 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1448  xanthine phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 
197 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000584742  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1086  xanthine phosphoribosyltransferase  26.23 
 
 
193 aa  58.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.821507  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5520  xanthine phosphoribosyltransferase  26.4 
 
 
190 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 
187 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0205  xanthine phosphoribosyltransferase  27.2 
 
 
190 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605547 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0112  xanthine phosphoribosyltransferase  25.6 
 
 
189 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2173  xanthine phosphoribosyltransferase  24.43 
 
 
188 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0867075  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0628  xanthine phosphoribosyltransferase  26.02 
 
 
193 aa  56.2  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00387933  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0229  xanthine phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 
192 aa  56.2  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115581  hitchhiker  6.642120000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
172 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
175 aa  55.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5265  xanthine phosphoribosyltransferase  26.4 
 
 
190 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5317  xanthine phosphoribosyltransferase  26.4 
 
 
190 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0748508  normal  0.105571 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  24.48 
 
 
180 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  27.34 
 
 
173 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  26.7 
 
 
182 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5175  xanthine phosphoribosyltransferase  26.4 
 
 
190 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458979  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0545  adenine phosphoribosyltransferase  27.1 
 
 
173 aa  55.1  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.342183  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1684  adenine phosphoribosyltransferase  24.36 
 
 
190 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0340308  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  25.17 
 
 
181 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0720  xanthine phosphoribosyltransferase  25.62 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000414905  normal  0.141539 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0319  xanthine phosphoribosyltransferase  26.19 
 
 
190 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0313  xanthine phosphoribosyltransferase  26.19 
 
 
190 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0557  adenine phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 
189 aa  53.9  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0165783  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  25.17 
 
 
180 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1498  xanthine phosphoribosyltransferase  25.4 
 
 
192 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00482653  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1287  xanthine phosphoribosyltransferase  25.4 
 
 
192 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11335  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  27.54 
 
 
173 aa  53.9  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14411  adenine phosphoribosyltransferase  26.52 
 
 
172 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00395  adenine phosphoribosyltransferase  26.87 
 
 
186 aa  53.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0435  xanthine phosphoribosyltransferase  26.24 
 
 
192 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.584524  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  24.64 
 
 
172 aa  52.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0497  adenine phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 
170 aa  52.8  0.000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.742896  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0446  xanthine phosphoribosyltransferase  26.24 
 
 
192 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1405  xanthine phosphoribosyltransferase  24.5 
 
 
190 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  27.03 
 
 
193 aa  52  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>