185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3381 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3381  xanthine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
194 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00123669  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2968  xanthine phosphoribosyltransferase  70.16 
 
 
191 aa  273  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0628  xanthine phosphoribosyltransferase  60.42 
 
 
193 aa  235  4e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00387933  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0364  xanthine phosphoribosyltransferase  60.42 
 
 
193 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0319  xanthine phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 
190 aa  224  6e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0313  xanthine phosphoribosyltransferase  58.33 
 
 
190 aa  224  6e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1405  xanthine phosphoribosyltransferase  58.95 
 
 
190 aa  222  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17850  xanthine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 
192 aa  218  6e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1498  xanthine phosphoribosyltransferase  56.7 
 
 
192 aa  214  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00482653  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1287  xanthine phosphoribosyltransferase  56.7 
 
 
192 aa  214  5e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1302  xanthine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
197 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.550156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1697  xanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
197 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1490  xanthine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
197 aa  186  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3719  xanthine phosphoribosyltransferase  49.47 
 
 
197 aa  184  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1626  xanthine phosphoribosyltransferase  48.95 
 
 
197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1475  xanthine phosphoribosyltransferase  50.55 
 
 
197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0761652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  50.55 
 
 
197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1448  xanthine phosphoribosyltransferase  50.55 
 
 
197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000584742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1591  xanthine phosphoribosyltransferase  50.55 
 
 
197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.556835  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0720  xanthine phosphoribosyltransferase  49.17 
 
 
196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000414905  normal  0.141539 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1737  xanthine phosphoribosyltransferase  50.55 
 
 
197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000180349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1661  xanthine phosphoribosyltransferase  50.55 
 
 
197 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.855078 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0435  xanthine phosphoribosyltransferase  49.21 
 
 
192 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.584524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0446  xanthine phosphoribosyltransferase  49.21 
 
 
192 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210484  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0537  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  46.84 
 
 
206 aa  175  4e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0798782  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1265  xanthine phosphoribosyltransferase  46.32 
 
 
197 aa  171  5.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.165454  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1086  xanthine phosphoribosyltransferase  48.95 
 
 
193 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.821507  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2147  xanthine phosphoribosyltransferase  48.35 
 
 
193 aa  170  1e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69940  xanthine phosphoribosyltransferase  48.07 
 
 
190 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0067  xanthine phosphoribosyltransferase  46.56 
 
 
192 aa  169  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00414676  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6072  xanthine phosphoribosyltransferase  48.07 
 
 
190 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  44.56 
 
 
191 aa  169  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0902677  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2755  xanthine phosphoribosyltransferase  45.3 
 
 
190 aa  167  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5520  xanthine phosphoribosyltransferase  48.95 
 
 
190 aa  167  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5265  xanthine phosphoribosyltransferase  47.89 
 
 
190 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5317  xanthine phosphoribosyltransferase  47.89 
 
 
190 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0748508  normal  0.105571 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0251  xanthine phosphoribosyltransferase  46.84 
 
 
190 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5175  xanthine phosphoribosyltransferase  47.89 
 
 
190 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458979  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0205  xanthine phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 
190 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0076  xanthine phosphoribosyltransferase  47.12 
 
 
189 aa  164  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287774  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2387  xanthine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 
195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0112  xanthine phosphoribosyltransferase  46.6 
 
 
189 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0229  xanthine phosphoribosyltransferase  47.42 
 
 
192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115581  hitchhiker  6.642120000000001e-23 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  44.75 
 
 
190 aa  161  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2173  xanthine phosphoribosyltransferase  46.07 
 
 
188 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0867075  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2059  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  45.26 
 
 
189 aa  151  7e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0380  xanthine phosphoribosyltransferase  47.22 
 
 
192 aa  150  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000351735  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0491  xanthine phosphoribosyltransferase  39.06 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2510  xanthine phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0705495  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46613  predicted protein  33.33 
 
 
798 aa  119  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2135  xanthine phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0041  pur operon repressor  30.82 
 
 
282 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0051  pur operon repressor  30.82 
 
 
282 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0044  pur operon repressor  30.82 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0045  pur operon repressor  30.82 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0041  pur operon repressor  30.82 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0041  pur operon repressor  30.82 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0044  pur operon repressor  30.82 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0051  pur operon repressor  30.82 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000444912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5265  pur operon repressor  30.82 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.549004  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0055  pur operon repressor  30.82 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.748352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0041  pur operon repressor  31.51 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0058  pur operon repressor  31.9 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2400  pur operon repressor  30.89 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0042  pur operon repressor  29.6 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00214648  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0040  pur operon repressor  28.8 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0517  pur operon repressor  30.33 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00109684  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0530  pur operon repressor  30.33 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000100819  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0134  pur operon repressor  29.51 
 
 
274 aa  67.8  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000199065  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0210  pur operon repressor  26.75 
 
 
278 aa  67.8  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000033257  normal  0.0176248 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1765  pur operon repressor  27.63 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.011589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0089  pur operon repressor  27.63 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1772  pur operon repressor  25.32 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000200517  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3095  pur operon repressor  29.75 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.933063  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1785  adenine phosphoribosyltransferase  32.85 
 
 
248 aa  61.6  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21340  pur operon repressor  29.03 
 
 
271 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2627  pur operon repressor  32.8 
 
 
272 aa  58.9  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1111  adenine phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0219  pur operon repressor  26.32 
 
 
281 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000738086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0584  pur operon repressor  28.1 
 
 
274 aa  55.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1633  adenine phosphoribosyltransferase  26.49 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2871  adenine phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 
189 aa  55.1  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.277203 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2612  adenine phosphoribosyltransferase  29.01 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1435  adenine phosphoribosyltransferase  24.73 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  28.89 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1847  adenine phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.820811  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0557  adenine phosphoribosyltransferase  32.82 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0165783  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2815  pur operon repressor  27.83 
 
 
267 aa  52.8  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1496  adenine phosphoribosyltransferase  26.26 
 
 
183 aa  52.4  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1530  adenine phosphoribosyltransferase  25.43 
 
 
185 aa  52  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0023  phosphoribosyltransferase  33.93 
 
 
235 aa  52  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00393898 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2501  pur operon repressor  26.96 
 
 
267 aa  51.6  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2590  pur operon repressor  24.8 
 
 
271 aa  51.6  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 
185 aa  51.6  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  31.52 
 
 
172 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0563  adenine phosphoribosyltransferase  27.73 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0138344 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0805  adenine phosphoribosyltransferase  24.28 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.129708  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1608  pur operon repressor  24.68 
 
 
277 aa  51.2  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0497  adenine phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 
170 aa  50.4  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.742896  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1145  adenine phosphoribosyltransferase  25 
 
 
185 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>