More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1530 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1530  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
185 aa  365  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0805  adenine phosphoribosyltransferase  97.84 
 
 
185 aa  361  3e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.129708  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1145  adenine phosphoribosyltransferase  96.22 
 
 
185 aa  358  4e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1150  adenine phosphoribosyltransferase  91.35 
 
 
185 aa  338  2.9999999999999998e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1496  adenine phosphoribosyltransferase  70.33 
 
 
183 aa  277  5e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2167  adenine phosphoribosyltransferase  60.44 
 
 
182 aa  214  5.9999999999999996e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.582672  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1111  adenine phosphoribosyltransferase  54.7 
 
 
190 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1847  adenine phosphoribosyltransferase  54.05 
 
 
183 aa  193  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.820811  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1435  adenine phosphoribosyltransferase  54.05 
 
 
190 aa  192  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1118  adenine phosphoribosyltransferase  53.3 
 
 
189 aa  191  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361734  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0837  phosphoribosyltransferase  47.54 
 
 
185 aa  190  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1633  adenine phosphoribosyltransferase  51.63 
 
 
190 aa  187  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0557  adenine phosphoribosyltransferase  51.35 
 
 
189 aa  185  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0165783  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2612  adenine phosphoribosyltransferase  55.87 
 
 
182 aa  185  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2081  adenine phosphoribosyltransferase  59.54 
 
 
182 aa  184  9e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2484  phosphoribosyltransferase  49.17 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0493331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2871  adenine phosphoribosyltransferase  52.94 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.277203 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0884  phosphoribosyltransferase  50.28 
 
 
189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0219  adenine phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
187 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3110  phosphoribosyltransferase  50.83 
 
 
181 aa  180  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2004  phosphoribosyltransferase  46.99 
 
 
181 aa  174  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0414  adenine phosphoribosyltransferase  37.3 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2490  phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 
186 aa  124  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4140  adenine phosphoribosyltransferase  36.56 
 
 
188 aa  124  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  0.0159521 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4088  adenine phosphoribosyltransferase  36.72 
 
 
188 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.518332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0074  adenine phosphoribosyltransferase  37.43 
 
 
182 aa  121  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2165  adenine phosphoribosyltransferase  31.18 
 
 
187 aa  118  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798656  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0219  pur operon repressor  30.72 
 
 
281 aa  66.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000738086  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3426  adenine phosphoribosyltransferase  32.59 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6143  orotate phosphoribosyltransferase  26.62 
 
 
176 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360288  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  27.71 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44500  adenine phosphoribosyltransferase  32.33 
 
 
182 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.772947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3789  adenine phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1990  adenine phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0806  adenine phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 
176 aa  62.4  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.401201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3584  adenine phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
182 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4266  adenine phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
182 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262007  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3831  adenine phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
182 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.660838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1602  adenine phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
182 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.143258 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0497  adenine phosphoribosyltransferase  32.12 
 
 
170 aa  59.7  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.742896  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  25.16 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  33.58 
 
 
175 aa  59.3  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3201  adenine phosphoribosyltransferase  31.75 
 
 
157 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.706653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1810  adenine phosphoribosyltransferase  27.44 
 
 
182 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1108  orotate phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 
172 aa  58.2  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.10081  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2616  adenine phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 
182 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0092322  normal  0.996002 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  29.32 
 
 
173 aa  57.8  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5265  xanthine phosphoribosyltransferase  25.64 
 
 
190 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0112  xanthine phosphoribosyltransferase  26.88 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0251  xanthine phosphoribosyltransferase  24.84 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2232  adenine phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 
180 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0145  normal  0.61649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5175  xanthine phosphoribosyltransferase  25.64 
 
 
190 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458979  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 
181 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5317  xanthine phosphoribosyltransferase  25.64 
 
 
190 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0748508  normal  0.105571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15120  adenine phosphoribosyltransferase  30.84 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2387  xanthine phosphoribosyltransferase  25.16 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0076  xanthine phosphoribosyltransferase  26.25 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287774  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4002  orotate phosphoribosyltransferase  27.03 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00738468  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  28.91 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  29.5 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  27.46 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0532  orotate phosphoribosyltransferase  31.09 
 
 
188 aa  55.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
171 aa  55.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  32.76 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2783  orotate phosphoribosyltransferase  27.75 
 
 
174 aa  56.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 
181 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0690  orotate phosphoribosyltransferase  29.22 
 
 
180 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 
181 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl276  adenine phosphoribosyltransferase  33.06 
 
 
170 aa  55.5  0.0000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000600787  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  24.72 
 
 
166 aa  55.5  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
186 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0205  xanthine phosphoribosyltransferase  25.64 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605547 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
180 aa  55.1  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69940  xanthine phosphoribosyltransferase  24.22 
 
 
190 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 
181 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 
183 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  27.1 
 
 
191 aa  55.1  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
180 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1921  orotate phosphoribosyltransferase  30.4 
 
 
207 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  31.01 
 
 
183 aa  55.1  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  26.49 
 
 
173 aa  55.1  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  26.47 
 
 
187 aa  54.7  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  30.58 
 
 
179 aa  54.7  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  32.67 
 
 
198 aa  54.7  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  29.22 
 
 
180 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6072  xanthine phosphoribosyltransferase  24.22 
 
 
190 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 
183 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0697  adenine phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  unclonable  0.0000000000521576 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 
183 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0540  adenine phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  32.81 
 
 
177 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 
183 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 
183 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>