More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2081 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2081  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2167  adenine phosphoribosyltransferase  71.67 
 
 		 182 aa  273  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.582672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1847  adenine phosphoribosyltransferase  69.44 
 
 		 183 aa  254  5e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.820811  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0219  adenine phosphoribosyltransferase  60 
 
 		 187 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2612  adenine phosphoribosyltransferase  55.8 
 
 		 182 aa  211  5.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1150  adenine phosphoribosyltransferase  58.76 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1530  adenine phosphoribosyltransferase  58.76 
 
 		 185 aa  194  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0805  adenine phosphoribosyltransferase  58.96 
 
 		 185 aa  194  7e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.129708  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1496  adenine phosphoribosyltransferase  57.8 
 
 		 183 aa  194  7e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1145  adenine phosphoribosyltransferase  57.63 
 
 		 185 aa  193  9e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1633  adenine phosphoribosyltransferase  54.19 
 
 		 190 aa  185  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1111  adenine phosphoribosyltransferase  52.51 
 
 		 190 aa  180  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1435  adenine phosphoribosyltransferase  53.67 
 
 		 190 aa  177  9e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2004  phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2871  adenine phosphoribosyltransferase  53.59 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.277203 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3110  phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0884  phosphoribosyltransferase  48 
 
 		 189 aa  174  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2484  phosphoribosyltransferase  46.24 
 
 		 189 aa  174  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0493331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0557  adenine phosphoribosyltransferase  45.16 
 
 		 189 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0165783  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1118  adenine phosphoribosyltransferase  51.61 
 
 		 189 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0837  phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 		 185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2490  phosphoribosyltransferase  48.57 
 
 		 186 aa  144  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0414  adenine phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4088  adenine phosphoribosyltransferase  36.08 
 
 		 188 aa  90.9  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.518332  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4140  adenine phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  0.0159521 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0074  adenine phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2165  adenine phosphoribosyltransferase  33.83 
 
 		 187 aa  85.5  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2387  xanthine phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0537  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  27.56 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0798782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1302  xanthine phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.550156  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1697  xanthine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3719  xanthine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1475  xanthine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0761652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1448  xanthine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000584742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1591  xanthine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.556835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1661  xanthine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.855078 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1626  xanthine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 197 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1737  xanthine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000180349  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1684  adenine phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0340308  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  38.05 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1490  xanthine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  35.45 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0806  adenine phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.401201  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  34.55 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  33.06 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3201  adenine phosphoribosyltransferase  35.45 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.706653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6072  xanthine phosphoribosyltransferase  27.61 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  27.85 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  32.81 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  32.81 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  26.56 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  27.85 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69940  xanthine phosphoribosyltransferase  27.61 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0251  xanthine phosphoribosyltransferase  28.15 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0319  xanthine phosphoribosyltransferase  31.61 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0313  xanthine phosphoribosyltransferase  31.61 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  27.22 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  36.28 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  34.82 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  29.6 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1086  xanthine phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.821507  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29461  adenine phosphoribosyltransferase  27.22 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.268301  normal  0.53722 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0076  xanthine phosphoribosyltransferase  28 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  34.82 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5520  xanthine phosphoribosyltransferase  28.35 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  31.73 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1133  adenine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  32.73 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14741  adenine phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0518305 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  34.82 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  34.82 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  32.73 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00395  adenine phosphoribosyltransferase  27.54 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  34.82 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  34.58 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  34.82 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5317  xanthine phosphoribosyltransferase  28.35 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0748508  normal  0.105571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>