295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0414 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0414  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
187 aa  377  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4140  adenine phosphoribosyltransferase  59.68 
 
 
188 aa  227  9e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  0.0159521 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4088  adenine phosphoribosyltransferase  59.14 
 
 
188 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.518332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0074  adenine phosphoribosyltransferase  59.67 
 
 
182 aa  220  7e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2165  adenine phosphoribosyltransferase  55.38 
 
 
187 aa  214  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798656  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1496  adenine phosphoribosyltransferase  43.43 
 
 
183 aa  143  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1145  adenine phosphoribosyltransferase  37.3 
 
 
185 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1150  adenine phosphoribosyltransferase  37.3 
 
 
185 aa  130  9e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0805  adenine phosphoribosyltransferase  37.3 
 
 
185 aa  130  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.129708  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1530  adenine phosphoribosyltransferase  37.3 
 
 
185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1633  adenine phosphoribosyltransferase  37.64 
 
 
190 aa  114  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1111  adenine phosphoribosyltransferase  37.36 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1435  adenine phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 
190 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2871  adenine phosphoribosyltransferase  33.72 
 
 
189 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.277203 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0837  phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 
185 aa  102  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2004  phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 
181 aa  101  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0557  adenine phosphoribosyltransferase  32.45 
 
 
189 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0165783  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3110  phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 
181 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1847  adenine phosphoribosyltransferase  35 
 
 
183 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.820811  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2167  adenine phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 
182 aa  98.2  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.582672  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2484  phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 
189 aa  97.8  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0493331  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1118  adenine phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
189 aa  97.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361734  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0219  adenine phosphoribosyltransferase  34.94 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0884  phosphoribosyltransferase  32.95 
 
 
189 aa  95.5  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2612  adenine phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2081  adenine phosphoribosyltransferase  36.3 
 
 
182 aa  88.6  5e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2490  phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2510  xanthine phosphoribosyltransferase  28.49 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0705495  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3201  adenine phosphoribosyltransferase  30.5 
 
 
157 aa  59.3  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.706653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5265  xanthine phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5317  xanthine phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0748508  normal  0.105571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  32.04 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0251  xanthine phosphoribosyltransferase  28.17 
 
 
190 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5175  xanthine phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.458979  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  31.75 
 
 
181 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  43.37 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
181 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
180 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  30.11 
 
 
182 aa  55.8  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0537  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  32.8 
 
 
206 aa  54.7  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0798782  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 
168 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  35.59 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0205  xanthine phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605547 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
183 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1069  adenine phosphoribosyltransferase  25.43 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  31.37 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0112  xanthine phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 
189 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  35.9 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69940  xanthine phosphoribosyltransferase  27.43 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  25.26 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
181 aa  52.8  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0089  pur operon repressor  32.03 
 
 
278 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0532  orotate phosphoribosyltransferase  28.98 
 
 
180 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00117498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2173  xanthine phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0867075  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5520  xanthine phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
190 aa  52  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 
178 aa  52  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6072  xanthine phosphoribosyltransferase  24.71 
 
 
190 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 
183 aa  51.6  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1944  Adenine phosphoribosyltransferase  41.27 
 
 
186 aa  51.6  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00976399  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12301  adenine phosphoribosyltransferase  28.28 
 
 
170 aa  51.6  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  37.68 
 
 
180 aa  51.2  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  32.06 
 
 
198 aa  51.2  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  43.55 
 
 
184 aa  51.2  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15120  adenine phosphoribosyltransferase  28.18 
 
 
175 aa  51.2  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0506  orotate phosphoribosyltransferase  28.35 
 
 
193 aa  51.2  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.179703 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2387  xanthine phosphoribosyltransferase  25.52 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0076  xanthine phosphoribosyltransferase  26.46 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287774  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0772  phosphoribosyltransferase  26.12 
 
 
264 aa  50.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.15147  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  43.55 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
172 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  43.55 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0491  xanthine phosphoribosyltransferase  29.8 
 
 
202 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  31.11 
 
 
197 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  43.55 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  43.55 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  43.55 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  43.55 
 
 
183 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  43.55 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1086  xanthine phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.821507  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  27.97 
 
 
172 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  28.45 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  28.08 
 
 
169 aa  50.1  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  43.08 
 
 
179 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  36.23 
 
 
181 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  39.34 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  28.23 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  26.89 
 
 
187 aa  49.7  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  34.19 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  34.19 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  34.19 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>