More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2167 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2167  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
182 aa  363  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.582672  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2081  adenine phosphoribosyltransferase  71.67 
 
 
182 aa  259  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1847  adenine phosphoribosyltransferase  70 
 
 
183 aa  255  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.820811  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0219  adenine phosphoribosyltransferase  63.48 
 
 
187 aa  226  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0805  adenine phosphoribosyltransferase  62.09 
 
 
185 aa  217  7e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.129708  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1145  adenine phosphoribosyltransferase  62.09 
 
 
185 aa  217  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1150  adenine phosphoribosyltransferase  60.75 
 
 
185 aa  214  5e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1530  adenine phosphoribosyltransferase  60.44 
 
 
185 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2612  adenine phosphoribosyltransferase  55.11 
 
 
182 aa  214  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1496  adenine phosphoribosyltransferase  58.86 
 
 
183 aa  204  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1111  adenine phosphoribosyltransferase  56.22 
 
 
190 aa  195  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1118  adenine phosphoribosyltransferase  49.72 
 
 
189 aa  182  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361734  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1633  adenine phosphoribosyltransferase  48.6 
 
 
190 aa  177  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1435  adenine phosphoribosyltransferase  51.35 
 
 
190 aa  177  7e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3110  phosphoribosyltransferase  48.3 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0557  adenine phosphoribosyltransferase  46.33 
 
 
189 aa  171  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0165783  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2871  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 
189 aa  167  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.277203 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2004  phosphoribosyltransferase  46.59 
 
 
181 aa  166  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0837  phosphoribosyltransferase  45.05 
 
 
185 aa  166  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0884  phosphoribosyltransferase  44.07 
 
 
189 aa  164  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2484  phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
189 aa  162  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0493331  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2490  phosphoribosyltransferase  48 
 
 
186 aa  147  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0414  adenine phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 
187 aa  98.2  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4140  adenine phosphoribosyltransferase  33.14 
 
 
188 aa  89.4  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  0.0159521 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0074  adenine phosphoribosyltransferase  33.14 
 
 
182 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654407  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4088  adenine phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 
188 aa  89  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.518332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2165  adenine phosphoribosyltransferase  34.46 
 
 
187 aa  88.2  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798656  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0806  adenine phosphoribosyltransferase  33.06 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.401201  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  32.59 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2232  adenine phosphoribosyltransferase  32.93 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0145  normal  0.61649 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  39.62 
 
 
171 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  35.45 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0319  xanthine phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0313  xanthine phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 
190 aa  63.2  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  30.53 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  32.59 
 
 
180 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
173 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  32.82 
 
 
181 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  34.96 
 
 
170 aa  61.6  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 
179 aa  62  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  32.82 
 
 
180 aa  61.6  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1684  adenine phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 
190 aa  61.2  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0340308  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
181 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1697  xanthine phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 
197 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1475  xanthine phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 
197 aa  61.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0761652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1447  xanthine phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 
197 aa  61.2  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1448  xanthine phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 
197 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000584742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1591  xanthine phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 
197 aa  61.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.556835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  36.54 
 
 
171 aa  61.2  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1661  xanthine phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 
197 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.855078 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1737  xanthine phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 
197 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000180349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1626  xanthine phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 
197 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3719  xanthine phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 
197 aa  60.8  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  28.68 
 
 
179 aa  60.8  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 
199 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1044  adenine phosphoribosyltransferase  29.3 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0537  adenine/guanine phosphoribosyltransferase-like protein  27.56 
 
 
206 aa  60.5  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0798782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  28.86 
 
 
172 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0491  xanthine phosphoribosyltransferase  27.89 
 
 
202 aa  59.7  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1490  xanthine phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
171 aa  59.7  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 
171 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
181 aa  59.3  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  28.89 
 
 
179 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1201  adenine phosphoribosyltransferase  28.08 
 
 
174 aa  58.5  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3201  adenine phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
157 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.706653  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  35.65 
 
 
187 aa  58.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1302  xanthine phosphoribosyltransferase  27.01 
 
 
197 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.550156  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15120  adenine phosphoribosyltransferase  30.32 
 
 
175 aa  57.8  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
171 aa  57.8  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  34.55 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3426  adenine phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  32 
 
 
171 aa  55.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  35.65 
 
 
177 aa  55.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  30.37 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  35.09 
 
 
177 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1990  adenine phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160211  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  36.79 
 
 
172 aa  55.1  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  34.11 
 
 
196 aa  55.1  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  29.77 
 
 
214 aa  55.1  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 
172 aa  54.7  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
181 aa  54.7  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0497  adenine phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 
170 aa  54.7  0.0000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.742896  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1405  xanthine phosphoribosyltransferase  26.72 
 
 
190 aa  54.7  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000101739  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 
177 aa  54.7  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
183 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
183 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
183 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>