More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1684 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1684  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0340308  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 		 173 aa  166  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0806  adenine phosphoribosyltransferase  44.32 
 
 		 176 aa  161  5.0000000000000005e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.401201  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 		 171 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  43.93 
 
 		 173 aa  154  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3653  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 		 174 aa  153  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 		 180 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 		 177 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 		 172 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2050  adenine phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 		 180 aa  152  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 		 180 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  46.2 
 
 		 181 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 		 182 aa  150  8e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6114  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  45.12 
 
 		 171 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  44.69 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  46.75 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  44.05 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1005  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 		 182 aa  148  5e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.233001  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 		 181 aa  148  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 		 181 aa  148  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0887  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 		 182 aa  148  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 		 181 aa  148  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0934  adenine phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 		 182 aa  148  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.648233  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2795  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 		 172 aa  148  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0531  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 		 188 aa  147  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0784653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  47.3 
 
 		 171 aa  147  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2702  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  43.68 
 
 		 172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  43.68 
 
 		 172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2844  adenine phosphoribosyltransferase  45.88 
 
 		 188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  43.29 
 
 		 172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  43.37 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  44.59 
 
 		 424 aa  146  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  45.29 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  48.37 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  42.68 
 
 		 175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  45.29 
 
 		 181 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 		 171 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  44.03 
 
 		 181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0873  adenine phosphoribosyltransferase  43.29 
 
 		 170 aa  145  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.369684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  43.53 
 
 		 181 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  41.82 
 
 		 171 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2170  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 		 188 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2784  adenine phosphoribosyltransferase  44.51 
 
 		 188 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 		 184 aa  144  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2613  adenine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 		 172 aa  144  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  39.77 
 
 		 173 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 181 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 		 170 aa  144  9e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  44.05 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0401  adenine phosphoribosyltransferase  42.17 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  45.73 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6052  adenine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 		 185 aa  143  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  46.95 
 
 		 170 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  45.78 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  45.78 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  41.76 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 		 184 aa  144  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  43.93 
 
 		 180 aa  143  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  40.46 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  41.52 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 		 179 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  44.05 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  46.3 
 
 		 178 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 		 171 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  43.65 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1201  adenine phosphoribosyltransferase  42.44 
 
 		 174 aa  142  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  43.26 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  39.64 
 
 		 175 aa  142  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1819  adenine phosphoribosyltransferase  46.99 
 
 		 170 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0215427  normal  0.463714 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 		 171 aa  141  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 		 187 aa  141  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 		 187 aa  141  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  42.6 
 
 		 171 aa  140  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0435  adenine phosphoribosyltransferase  47.56 
 
 		 170 aa  140  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0752595 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  45.68 
 
 		 178 aa  140  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  42.07 
 
 		 172 aa  140  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0836  adenine phosphoribosyltransferase  45.86 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 		 172 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0545  adenine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.342183  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2232  adenine phosphoribosyltransferase  44.32 
 
 		 180 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0145  normal  0.61649 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  46.58 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0333  adenine phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 		 188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 		 214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0798  adenine phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0128483  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0802  adenine phosphoribosyltransferase  45.24 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  43.79 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3739  adenine phosphoribosyltransferase  46.43 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0293809  normal  0.608797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  42.51 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 		 184 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  43.37 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>