More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1111 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1111  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
190 aa  373  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1496  adenine phosphoribosyltransferase  57.78 
 
 
183 aa  210  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1633  adenine phosphoribosyltransferase  56.35 
 
 
190 aa  202  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1145  adenine phosphoribosyltransferase  54.05 
 
 
185 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1530  adenine phosphoribosyltransferase  54.7 
 
 
185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0805  adenine phosphoribosyltransferase  54.05 
 
 
185 aa  197  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.129708  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1150  adenine phosphoribosyltransferase  54.7 
 
 
185 aa  197  6e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1435  adenine phosphoribosyltransferase  53.98 
 
 
190 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2167  adenine phosphoribosyltransferase  56.22 
 
 
182 aa  195  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.582672  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0557  adenine phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 
189 aa  194  5.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0165783  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1847  adenine phosphoribosyltransferase  55.8 
 
 
183 aa  193  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.820811  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2871  adenine phosphoribosyltransferase  54.65 
 
 
189 aa  187  7e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.277203 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2484  phosphoribosyltransferase  49.73 
 
 
189 aa  186  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0493331  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1118  adenine phosphoribosyltransferase  51.35 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361734  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2612  adenine phosphoribosyltransferase  50.26 
 
 
182 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0884  phosphoribosyltransferase  49.73 
 
 
189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0219  adenine phosphoribosyltransferase  51.35 
 
 
187 aa  174  9e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2081  adenine phosphoribosyltransferase  52.51 
 
 
182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2004  phosphoribosyltransferase  48.6 
 
 
181 aa  171  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0837  phosphoribosyltransferase  46.96 
 
 
185 aa  169  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3110  phosphoribosyltransferase  46.59 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2490  phosphoribosyltransferase  52.29 
 
 
186 aa  123  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0414  adenine phosphoribosyltransferase  37.36 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4140  adenine phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  0.0159521 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4088  adenine phosphoribosyltransferase  35.96 
 
 
188 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.518332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2165  adenine phosphoribosyltransferase  35.52 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798656  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0074  adenine phosphoribosyltransferase  36.26 
 
 
182 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654407  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3812  adenine phosphoribosyltransferase  34.03 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.526341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  35.66 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  35.88 
 
 
175 aa  68.2  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  34.92 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  34.92 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  34.92 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  33.6 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0806  adenine phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 
176 aa  62.8  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.401201  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  33.85 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
184 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  35.77 
 
 
186 aa  62.4  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  32.43 
 
 
205 aa  62  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  30.15 
 
 
181 aa  62  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2232  adenine phosphoribosyltransferase  29.05 
 
 
180 aa  61.6  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0145  normal  0.61649 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
187 aa  61.2  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17850  xanthine phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 
192 aa  61.2  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  33.85 
 
 
179 aa  61.2  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1990  adenine phosphoribosyltransferase  25.14 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.160211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3201  adenine phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.706653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 
184 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  29.21 
 
 
177 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29461  adenine phosphoribosyltransferase  31.15 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.268301  normal  0.53722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  31.75 
 
 
179 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
175 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  29.5 
 
 
169 aa  59.3  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
172 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  29.45 
 
 
182 aa  58.9  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  29.07 
 
 
194 aa  58.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0558  adenine phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 
173 aa  58.5  0.00000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.176929  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1596  adenine phosphoribosyltransferase  28.35 
 
 
170 aa  58.5  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000374583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 
187 aa  58.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 
179 aa  58.5  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  32.54 
 
 
181 aa  58.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 
197 aa  58.5  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 
187 aa  58.5  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0227  adenine phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
172 aa  58.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  29.6 
 
 
179 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  34.43 
 
 
180 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  34.43 
 
 
181 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 
172 aa  58.2  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1686  adenine phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
172 aa  57.8  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3426  adenine phosphoribosyltransferase  24.59 
 
 
182 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3381  xanthine phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00123669  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1842  adenine phosphoribosyltransferase  29.37 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.530485  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0915  adenine phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
172 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361097  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  29.5 
 
 
173 aa  57.4  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0545  adenine phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.342183  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1810  adenine phosphoribosyltransferase  26.71 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 
172 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15120  adenine phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
175 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  29.76 
 
 
179 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0697  adenine phosphoribosyltransferase  37.04 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0120188  unclonable  0.0000000000521576 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0333  adenine phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3789  adenine phosphoribosyltransferase  26.85 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  27.43 
 
 
170 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  28 
 
 
170 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0540  adenine phosphoribosyltransferase  37.04 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 
185 aa  55.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  36.19 
 
 
179 aa  55.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47930  xanthine phosphoribosyltransferase  25.85 
 
 
190 aa  55.8  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  27.64 
 
 
181 aa  55.5  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 
180 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44500  adenine phosphoribosyltransferase  26.85 
 
 
182 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.772947 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  24.82 
 
 
178 aa  55.1  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1531  adenine phosphoribosyltransferase  28 
 
 
173 aa  55.1  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>