More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0219 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0219  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
187 aa  370  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2167  adenine phosphoribosyltransferase  63.48 
 
 
182 aa  226  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.582672  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1847  adenine phosphoribosyltransferase  56.15 
 
 
183 aa  207  8e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.820811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2081  adenine phosphoribosyltransferase  60 
 
 
182 aa  201  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2612  adenine phosphoribosyltransferase  52.41 
 
 
182 aa  190  9e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0805  adenine phosphoribosyltransferase  52.11 
 
 
185 aa  182  3e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.129708  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1145  adenine phosphoribosyltransferase  51.58 
 
 
185 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1150  adenine phosphoribosyltransferase  52.63 
 
 
185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1530  adenine phosphoribosyltransferase  51.85 
 
 
185 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1496  adenine phosphoribosyltransferase  50.56 
 
 
183 aa  176  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1633  adenine phosphoribosyltransferase  48.13 
 
 
190 aa  175  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1111  adenine phosphoribosyltransferase  51.35 
 
 
190 aa  174  9e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1435  adenine phosphoribosyltransferase  48.17 
 
 
190 aa  170  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0557  adenine phosphoribosyltransferase  45.99 
 
 
189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0165783  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1118  adenine phosphoribosyltransferase  46.03 
 
 
189 aa  164  8e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361734  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0884  phosphoribosyltransferase  43.92 
 
 
189 aa  156  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2484  phosphoribosyltransferase  43.39 
 
 
189 aa  155  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0493331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2871  adenine phosphoribosyltransferase  46.02 
 
 
189 aa  154  8e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.277203 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0837  phosphoribosyltransferase  43.39 
 
 
185 aa  154  9e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2004  phosphoribosyltransferase  50.96 
 
 
181 aa  151  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3110  phosphoribosyltransferase  51.25 
 
 
181 aa  149  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2490  phosphoribosyltransferase  44.09 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0414  adenine phosphoribosyltransferase  34.94 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4140  adenine phosphoribosyltransferase  34.13 
 
 
188 aa  87  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  0.0159521 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4088  adenine phosphoribosyltransferase  34.73 
 
 
188 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.518332  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0074  adenine phosphoribosyltransferase  34.13 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2165  adenine phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798656  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0497  adenine phosphoribosyltransferase  35.34 
 
 
170 aa  64.7  0.0000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.742896  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  32.58 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  33.09 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  39.09 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  33.09 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 
198 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29461  adenine phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.268301  normal  0.53722 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0806  adenine phosphoribosyltransferase  33.88 
 
 
176 aa  62.8  0.000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.401201  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  36.43 
 
 
177 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  33.09 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
184 aa  62  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
172 aa  62  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
172 aa  62  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  33.56 
 
 
183 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  27.47 
 
 
179 aa  61.6  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  28.18 
 
 
179 aa  61.6  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  35.61 
 
 
187 aa  61.6  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
171 aa  61.2  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
182 aa  61.2  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
183 aa  61.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  30 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2974  adenine phosphoribosyltransferase  28.17 
 
 
170 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
183 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  34.65 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0319  xanthine phosphoribosyltransferase  30.48 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0313  xanthine phosphoribosyltransferase  30.48 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 
184 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
170 aa  58.9  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  30.94 
 
 
181 aa  58.9  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1201  adenine phosphoribosyltransferase  26.32 
 
 
174 aa  58.9  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  31.78 
 
 
179 aa  58.5  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  34.55 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12301  adenine phosphoribosyltransferase  25.71 
 
 
170 aa  58.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
180 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  28.33 
 
 
199 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1342  adenine phosphoribosyltransferase  39.45 
 
 
184 aa  58.5  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0382674  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  33.65 
 
 
170 aa  58.5  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  33.65 
 
 
171 aa  58.2  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  33.07 
 
 
181 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  36.97 
 
 
178 aa  58.2  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
182 aa  58.2  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1198  adenine phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 
172 aa  57.8  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.484506  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  29.94 
 
 
181 aa  57.8  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  28.65 
 
 
181 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 
170 aa  57.8  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
197 aa  57  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  33.65 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 
179 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  34.55 
 
 
180 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  32.73 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  28.74 
 
 
183 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  28.65 
 
 
187 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  27.71 
 
 
181 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  32.35 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>