More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3887 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3887  inner-membrane translocator  100 
 
 
376 aa  714    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0112097  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2030  inner-membrane translocator  48.6 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.9286  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  36.74 
 
 
835 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  36.51 
 
 
333 aa  179  8e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  37.7 
 
 
310 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  38.15 
 
 
348 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  37.38 
 
 
310 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2942  Monosaccharide-transporting ATPase  39.23 
 
 
332 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.868986 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  38.53 
 
 
345 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  39.29 
 
 
345 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  37.5 
 
 
340 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  38.69 
 
 
336 aa  170  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  38.24 
 
 
345 aa  170  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3426  inner-membrane translocator  37.15 
 
 
332 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  38.42 
 
 
345 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  37.94 
 
 
345 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  38.42 
 
 
345 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.94 
 
 
345 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.71 
 
 
345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  35.07 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  39.3 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  39.3 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  35.29 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  39.93 
 
 
319 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  41.4 
 
 
327 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  39.3 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  34.92 
 
 
314 aa  163  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4928  monosaccharide-transporting ATPase  37.11 
 
 
332 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  normal  0.698391 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  37.38 
 
 
311 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  37.38 
 
 
311 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  37.38 
 
 
311 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  37.38 
 
 
311 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  37.38 
 
 
311 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  37.38 
 
 
311 aa  159  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  37.38 
 
 
311 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  37.38 
 
 
311 aa  159  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  37.38 
 
 
311 aa  159  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  37.05 
 
 
311 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  35.76 
 
 
337 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  37.22 
 
 
345 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  37.22 
 
 
345 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  36.23 
 
 
345 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  37.22 
 
 
345 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  35.28 
 
 
341 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  34.82 
 
 
331 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0148  Monosaccharide-transporting ATPase  39.47 
 
 
332 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  35.96 
 
 
310 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  36.68 
 
 
345 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1654  ABC transporter permease protein  38.98 
 
 
344 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  37.05 
 
 
311 aa  156  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4599  inner-membrane translocator  39.51 
 
 
340 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.033778 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  35.51 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  35.51 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  35.83 
 
 
331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4336  Monosaccharide-transporting ATPase  39.38 
 
 
340 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.895812  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  35.47 
 
 
342 aa  156  7e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0275  inner-membrane translocator  30.96 
 
 
323 aa  156  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0561  inner-membrane translocator  40 
 
 
338 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  36.67 
 
 
342 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 
311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  36.19 
 
 
330 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  37.95 
 
 
339 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  36.19 
 
 
330 aa  153  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  36.19 
 
 
330 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  35.62 
 
 
325 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6711  sugar ABC transporter membrane protein  38.35 
 
 
346 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.629939  normal  0.227307 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  35 
 
 
334 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  32.03 
 
 
350 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2853  inner-membrane translocator  36.67 
 
 
317 aa  150  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  33.66 
 
 
317 aa  150  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0690  Monosaccharide-transporting ATPase  38.57 
 
 
348 aa  149  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0715844 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  36.39 
 
 
337 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  35.59 
 
 
347 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3204  inner-membrane translocator  36.51 
 
 
348 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000146759  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  37.54 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1826  inner-membrane translocator  34.47 
 
 
336 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1902  inner-membrane translocator  35.53 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227487  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  35.29 
 
 
341 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0922  monosaccharide-transporting ATPase  34.01 
 
 
309 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  35.41 
 
 
306 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1102  carbohydrate ABC transporter permease  33.55 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1813  sugar ABC transporter, permease protein  33.55 
 
 
294 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.429209  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0811  carbohydrate ABC transporter permease  33.55 
 
 
294 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11050  monosaccharide ABC transporter membrane protein  34.49 
 
 
358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0718  inner-membrane translocator  38.46 
 
 
341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.303584  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2075  carbohydrate ABC transporter permease  34.1 
 
 
279 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1602  monosaccharide-transporting ATPase  32.67 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  33.54 
 
 
333 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0155  inner-membrane translocator  32.12 
 
 
324 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00293955  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2604  inner-membrane translocator  38.11 
 
 
317 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.104291  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0539  inner-membrane translocator  37.66 
 
 
322 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0945  Monosaccharide-transporting ATPase  34.56 
 
 
335 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0035821  normal  0.067207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3353  inner-membrane translocator  39.54 
 
 
319 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7025  monosaccharide-transporting ATPase  35.82 
 
 
335 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.560665  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3322  monosaccharide-transporting ATPase  39.37 
 
 
327 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.897327  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4135  inner-membrane translocator  36.21 
 
 
321 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  34.29 
 
 
327 aa  144  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0880  Monosaccharide-transporting ATPase  34.56 
 
 
335 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0333312  normal  0.303688 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  34.06 
 
 
313 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  34.86 
 
 
330 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>