74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1001 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1001  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4128  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  48.13 
 
 		 209 aa  181  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4881  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  47.24 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.528433 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0457  sarcosine oxidase, gamma subunit  44.65 
 
 		 210 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4716  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  45.12 
 
 		 210 aa  174  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71510  sarcosine oxidase gamma subunit  47.17 
 
 		 211 aa  174  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6207  sarcosine oxidase subunit gamma  47.17 
 
 		 211 aa  174  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0349  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  46.73 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360839  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0348  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  46.23 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0326  sarcosine oxidase, gamma subunit family  46.23 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0654749 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5204  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  44.08 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2757  sarcosine oxidase gamma subunit  42.13 
 
 		 217 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4035  sarcosine oxidase, gamma subunit  39.44 
 
 		 198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2481  sarcosine oxidase, gamma subunit  39.44 
 
 		 198 aa  136  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4049  sarcosine oxidase, gamma subunit  38.07 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3859  sarcosine oxidase, gamma subunit  37.37 
 
 		 190 aa  101  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0271075  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0999  sarcosine oxidase subunit gamma  37.65 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0392  sarcosine oxidase gamma subunit  37.65 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1951  sarcosine oxidase gamma subunit  37.04 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1104  sarcosine oxidase subunit gamma  36.75 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0489  sarcosine oxidase, gamma subunit  36.81 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1859  sarcosine oxidase, gamma subunit  36.42 
 
 		 211 aa  95.5  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76541  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0049  sarcosine oxidase subunit gamma  36.2 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.507753 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3507  sarcosine oxidase gamma subunit  35.58 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5148  sarcosine oxidase, gamma subunit  36.36 
 
 		 210 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0488595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5131  sarcosine oxidase gamma subunit  35.58 
 
 		 210 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3219  sarcosine oxidase, gamma subunit  36.36 
 
 		 210 aa  91.7  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5066  sarcosine oxidase gamma subunit  33.68 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.586483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4543  sarcosine oxidase, gamma subunit  33.68 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4827  sarcosine oxidase, gamma subunit  39.52 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.880444  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3701  sarcosine oxidase, gamma subunit  40.71 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3330  sarcosine oxidase gamma subunit  33.74 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5051  Sarcosine oxidase gamma subunit  33.14 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247837 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3592  Sarcosine oxidase  34.86 
 
 		 216 aa  85.1  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1597  sarcosine oxidase, gamma subunit  32.54 
 
 		 218 aa  84.7  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18840  sarcosine oxidase gamma subunit  38.1 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2880  Sarcosine oxidase gamma subunit  37.59 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3355  sarcosine oxidase, gamma subunit family  35.17 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2749  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  32.49 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0942  sarcosine oxidase, gamma subunit  36.62 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3657  sarcosine oxidase, gamma subunit family  37.41 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4672  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3390  Sarcosine oxidase gamma subunit  35.86 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1946  sarcosine oxidase, gamma subunit  32.8 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3619  Sarcosine oxidase gamma subunit  35.2 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.340515  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0995  sarcosine oxidase, gamma subunit  36.59 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0903672  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0972  sarcosine oxidase, gamma subunit  28.9 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2690  putative sarcosine oxidase gamma subunit  33.54 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2484  sarcosine oxidase gamma subunit  38.16 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4703  sarcosine oxidase gamma subunit  30.51 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426146  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1580  Sarcosine oxidase gamma subunit  30.17 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1348  sarcosine oxidase, gamma subunit  33.54 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950834  normal  0.0205544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3994  Sarcosine oxidase gamma subunit  34.06 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1651  sarcosine oxidase gamma subunit  29.79 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3778  sarcosine oxidase gamma subunit  33.33 
 
 		 188 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269051  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1933  Sarcosine oxidase gamma subunit  31.58 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3286  sarcosine oxidase gamma subunit  30.53 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3739  sarcosine oxidase gamma subunit  33.33 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319491  normal  0.115073 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1873  sarcosine oxidase, gamma subunit  33.33 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.508679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4034  Sarcosine oxidase gamma subunit  33.87 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.484424 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5743  hypothetical protein  36.36 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0936885  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8587  Sarcosine oxidase gamma subunit  34.11 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661189  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2187  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.26 
 
 		 171 aa  49.3  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0516  sarcosine oxidase, gamma subunit  35.87 
 
 		 172 aa  49.3  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0488  sarcosine oxidase gamma subunit  36.49 
 
 		 111 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2221  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.25 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.818428  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2639  Sarcosine oxidase gamma subunit  35.23 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2363  sarcosine oxidase gamma subunit  34.62 
 
 		 153 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0866  sarcosine oxidase gamma subunit  32.17 
 
 		 179 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5632  Sarcosine oxidase gamma subunit  31.73 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0162  sarcosine oxidase, gamma subunit  35 
 
 		 64 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4916  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 815 aa  42.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3475  hypothetical protein  29.45 
 
 		 192 aa  42.7  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4871  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 825 aa  41.6  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862382  normal  0.731807 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0594  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.2 
 
 		 182 aa  41.6  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>