68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1651 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1651  sarcosine oxidase gamma subunit  100 
 
 		 209 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1933  Sarcosine oxidase gamma subunit  94.26 
 
 		 209 aa  387  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1580  Sarcosine oxidase gamma subunit  79.9 
 
 		 209 aa  307  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4703  sarcosine oxidase gamma subunit  41.34 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426146  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1946  sarcosine oxidase, gamma subunit  39.56 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4128  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  35.71 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5204  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  31.15 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1144  sarcosine oxidase, gamma subunit  35.84 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0349  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  30.94 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360839  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0326  sarcosine oxidase, gamma subunit family  30.94 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0654749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0348  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  30.94 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4881  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  30.6 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.528433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4716  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  30.81 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0457  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.88 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6207  sarcosine oxidase subunit gamma  37.86 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71510  sarcosine oxidase gamma subunit  37.86 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3859  sarcosine oxidase, gamma subunit  40.65 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0271075  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5632  Sarcosine oxidase gamma subunit  36.45 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5743  hypothetical protein  44.14 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0936885  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2880  Sarcosine oxidase gamma subunit  40.44 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2363  sarcosine oxidase gamma subunit  36.18 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3592  Sarcosine oxidase  33.59 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3448  sarcosine oxidase, gamma subunit  36.03 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7230  Sarcosine oxidase gamma subunit  43.9 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0171161  normal  0.102806 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2757  sarcosine oxidase gamma subunit  29.79 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3701  sarcosine oxidase, gamma subunit  34.11 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4035  sarcosine oxidase, gamma subunit  28.8 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2481  sarcosine oxidase, gamma subunit  28.8 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3507  sarcosine oxidase gamma subunit  32.31 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3286  sarcosine oxidase gamma subunit  36.84 
 
 		 177 aa  62  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1001  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  29.79 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1104  sarcosine oxidase subunit gamma  31.5 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1597  sarcosine oxidase, gamma subunit  28.86 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0392  sarcosine oxidase gamma subunit  33.88 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1951  sarcosine oxidase gamma subunit  33.88 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18840  sarcosine oxidase gamma subunit  35.25 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5051  Sarcosine oxidase gamma subunit  27.27 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247837 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0049  sarcosine oxidase subunit gamma  33.33 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.507753 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5148  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.4 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0488595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3219  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.4 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1859  sarcosine oxidase, gamma subunit  33.9 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76541  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3330  sarcosine oxidase gamma subunit  28.31 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621341 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5131  sarcosine oxidase gamma subunit  31.4 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0999  sarcosine oxidase subunit gamma  33.06 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0489  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.06 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2639  Sarcosine oxidase gamma subunit  32.05 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3619  Sarcosine oxidase gamma subunit  34.59 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.340515  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5066  sarcosine oxidase gamma subunit  29.85 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.586483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4543  sarcosine oxidase, gamma subunit  29.75 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2263  putative sarcosine oxidase  45 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0488  sarcosine oxidase gamma subunit  40 
 
 		 111 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0942  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.52 
 
 		 176 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4906  sarcosine oxidase, gamma subunit  34.96 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.167294 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1348  sarcosine oxidase, gamma subunit  29.29 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950834  normal  0.0205544 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2144  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.33 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0162  sarcosine oxidase, gamma subunit  40.98 
 
 		 64 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2690  putative sarcosine oxidase gamma subunit  29.29 
 
 		 185 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2449  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.58 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497358  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4034  Sarcosine oxidase gamma subunit  34.11 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.484424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3994  Sarcosine oxidase gamma subunit  34.11 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4827  sarcosine oxidase, gamma subunit  34.72 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.880444  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3739  sarcosine oxidase gamma subunit  34.11 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319491  normal  0.115073 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3355  sarcosine oxidase, gamma subunit family  28.1 
 
 		 182 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1873  sarcosine oxidase, gamma subunit  29.29 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.508679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4049  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.44 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0594  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.14 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2221  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.53 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.818428  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3657  sarcosine oxidase, gamma subunit family  28.17 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4672  normal  0.226521 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>