48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0488 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0488  sarcosine oxidase gamma subunit  100 
 
 		 111 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0392  sarcosine oxidase gamma subunit  100 
 
 		 211 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1859  sarcosine oxidase, gamma subunit  98.53 
 
 		 211 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76541  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1951  sarcosine oxidase gamma subunit  98.53 
 
 		 201 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0162  sarcosine oxidase, gamma subunit  98.44 
 
 		 64 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0999  sarcosine oxidase subunit gamma  91.3 
 
 		 211 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0049  sarcosine oxidase subunit gamma  87.88 
 
 		 210 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.507753 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3507  sarcosine oxidase gamma subunit  82.61 
 
 		 210 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1104  sarcosine oxidase subunit gamma  82.35 
 
 		 210 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3219  sarcosine oxidase, gamma subunit  79.41 
 
 		 210 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5148  sarcosine oxidase, gamma subunit  79.41 
 
 		 210 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0488595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5131  sarcosine oxidase gamma subunit  79.41 
 
 		 210 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5066  sarcosine oxidase gamma subunit  78.26 
 
 		 209 aa  123  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.586483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4543  sarcosine oxidase, gamma subunit  78.26 
 
 		 209 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0489  sarcosine oxidase, gamma subunit  78.26 
 
 		 210 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1597  sarcosine oxidase, gamma subunit  79.1 
 
 		 218 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5051  Sarcosine oxidase gamma subunit  77.61 
 
 		 218 aa  120  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247837 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3330  sarcosine oxidase gamma subunit  77.94 
 
 		 216 aa  120  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4827  sarcosine oxidase, gamma subunit  78.26 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.880444  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2880  Sarcosine oxidase gamma subunit  46.07 
 
 		 194 aa  70.5  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3859  sarcosine oxidase, gamma subunit  42.72 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0271075  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18840  sarcosine oxidase gamma subunit  40.7 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3701  sarcosine oxidase, gamma subunit  46.03 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0326  sarcosine oxidase, gamma subunit family  36.49 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0654749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0348  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  36.49 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71510  sarcosine oxidase gamma subunit  39.06 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6207  sarcosine oxidase subunit gamma  39.06 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2757  sarcosine oxidase gamma subunit  40.98 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0349  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  35.14 
 
 		 210 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360839  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4881  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  35.14 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.528433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3592  Sarcosine oxidase  41.94 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4128  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  32.81 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5204  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  31.25 
 
 		 210 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4716  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  32.81 
 
 		 210 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0457  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.25 
 
 		 210 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1001  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  34.38 
 
 		 219 aa  51.2  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5632  Sarcosine oxidase gamma subunit  39.66 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7230  Sarcosine oxidase gamma subunit  39.66 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0171161  normal  0.102806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1933  Sarcosine oxidase gamma subunit  40 
 
 		 209 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1651  sarcosine oxidase gamma subunit  40 
 
 		 209 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1580  Sarcosine oxidase gamma subunit  41.54 
 
 		 209 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5743  hypothetical protein  40.38 
 
 		 176 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0936885  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3619  Sarcosine oxidase gamma subunit  41.43 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.340515  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3355  sarcosine oxidase, gamma subunit family  38.1 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3657  sarcosine oxidase, gamma subunit family  36.51 
 
 		 182 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4672  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2749  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  31.75 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2481  sarcosine oxidase, gamma subunit  32.84 
 
 		 198 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4035  sarcosine oxidase, gamma subunit  32.84 
 
 		 198 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>