68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4035 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2481  sarcosine oxidase, gamma subunit  100 
 
 		 198 aa  403  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4035  sarcosine oxidase, gamma subunit  100 
 
 		 198 aa  403  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4881  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  53.09 
 
 		 210 aa  207  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.528433 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4716  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  52.82 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0457  sarcosine oxidase, gamma subunit  51.52 
 
 		 210 aa  201  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4128  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  52.28 
 
 		 209 aa  201  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2757  sarcosine oxidase gamma subunit  50 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0326  sarcosine oxidase, gamma subunit family  50.52 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0654749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0349  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  50.52 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360839  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0348  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  50.52 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71510  sarcosine oxidase gamma subunit  54.08 
 
 		 211 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6207  sarcosine oxidase subunit gamma  54.08 
 
 		 211 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5204  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  48.48 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1001  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  39.44 
 
 		 219 aa  136  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4049  sarcosine oxidase, gamma subunit  33.5 
 
 		 218 aa  104  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0999  sarcosine oxidase subunit gamma  33.33 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1104  sarcosine oxidase subunit gamma  30.56 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3330  sarcosine oxidase gamma subunit  33.99 
 
 		 216 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3219  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.41 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5148  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.41 
 
 		 210 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0488595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5131  sarcosine oxidase gamma subunit  31.41 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0489  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.13 
 
 		 210 aa  95.5  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0049  sarcosine oxidase subunit gamma  30.94 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.507753 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0392  sarcosine oxidase gamma subunit  31.69 
 
 		 211 aa  94.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3507  sarcosine oxidase gamma subunit  29.51 
 
 		 210 aa  94.4  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1859  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.15 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3859  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.75 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0271075  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1951  sarcosine oxidase gamma subunit  30.6 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5066  sarcosine oxidase gamma subunit  28.33 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.586483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4543  sarcosine oxidase, gamma subunit  28.33 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5051  Sarcosine oxidase gamma subunit  31.32 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247837 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4827  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.48 
 
 		 217 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.880444  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3778  sarcosine oxidase gamma subunit  31.33 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269051  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1597  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.77 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3657  sarcosine oxidase, gamma subunit family  32.89 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4672  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3355  sarcosine oxidase, gamma subunit family  33.55 
 
 		 182 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2749  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  32.88 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18840  sarcosine oxidase gamma subunit  28.32 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3619  Sarcosine oxidase gamma subunit  31.33 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.340515  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2880  Sarcosine oxidase gamma subunit  30.07 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3701  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.66 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0972  sarcosine oxidase, gamma subunit  32.12 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1580  Sarcosine oxidase gamma subunit  29.27 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3592  Sarcosine oxidase  26.09 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1946  sarcosine oxidase, gamma subunit  27.27 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1933  Sarcosine oxidase gamma subunit  25.81 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1651  sarcosine oxidase gamma subunit  28.8 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3286  sarcosine oxidase gamma subunit  29.81 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0995  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.43 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0903672  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0942  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.55 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3390  Sarcosine oxidase gamma subunit  31.4 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5743  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0936885  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2114  putative sarcosine oxidase, gamma subunit  28.83 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.52218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4703  sarcosine oxidase gamma subunit  25.9 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426146  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_004310  BR0232  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.35 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0304  sarcosine oxidase gamma subunit  25.87 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5632  Sarcosine oxidase gamma subunit  32.04 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8587  Sarcosine oxidase gamma subunit  30.83 
 
 		 171 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661189  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2363  sarcosine oxidase gamma subunit  27.86 
 
 		 153 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0594  sarcosine oxidase, gamma subunit  24.31 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3739  sarcosine oxidase gamma subunit  27.27 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319491  normal  0.115073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4034  Sarcosine oxidase gamma subunit  27.27 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.484424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3994  Sarcosine oxidase gamma subunit  26.85 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1348  sarcosine oxidase, gamma subunit  24.71 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950834  normal  0.0205544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2484  sarcosine oxidase gamma subunit  26.42 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2690  putative sarcosine oxidase gamma subunit  25.29 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0866  sarcosine oxidase gamma subunit  26.96 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2101  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>