72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3592 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3592  Sarcosine oxidase  100 
 
 		 216 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3701  sarcosine oxidase, gamma subunit  70.41 
 
 		 211 aa  273  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3859  sarcosine oxidase, gamma subunit  42.86 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0271075  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3619  Sarcosine oxidase gamma subunit  36.89 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.340515  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3219  sarcosine oxidase, gamma subunit  36.75 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5148  sarcosine oxidase, gamma subunit  36.75 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0488595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5131  sarcosine oxidase gamma subunit  36.75 
 
 		 210 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3507  sarcosine oxidase gamma subunit  36 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2880  Sarcosine oxidase gamma subunit  35.75 
 
 		 194 aa  94.7  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0049  sarcosine oxidase subunit gamma  36.69 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.507753 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18840  sarcosine oxidase gamma subunit  39.74 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4128  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  38.35 
 
 		 209 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0999  sarcosine oxidase subunit gamma  34.08 
 
 		 211 aa  92.8  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0392  sarcosine oxidase gamma subunit  34.64 
 
 		 211 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0489  sarcosine oxidase, gamma subunit  34.86 
 
 		 210 aa  91.7  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5066  sarcosine oxidase gamma subunit  34.29 
 
 		 209 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.586483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1859  sarcosine oxidase, gamma subunit  34.08 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76541  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1951  sarcosine oxidase gamma subunit  34.55 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0457  sarcosine oxidase, gamma subunit  37.8 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4543  sarcosine oxidase, gamma subunit  34.29 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1104  sarcosine oxidase subunit gamma  35.5 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4716  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  36.22 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5051  Sarcosine oxidase gamma subunit  32.12 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247837 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0349  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  36.84 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360839  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0326  sarcosine oxidase, gamma subunit family  36.84 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0654749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0348  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  36.84 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4881  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  36.84 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.528433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1001  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  34.86 
 
 		 219 aa  85.1  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5204  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  34.65 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1597  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.52 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3330  sarcosine oxidase gamma subunit  31.93 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621341 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6207  sarcosine oxidase subunit gamma  34.33 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71510  sarcosine oxidase gamma subunit  34.33 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4827  sarcosine oxidase, gamma subunit  37.59 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.880444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2757  sarcosine oxidase gamma subunit  27.27 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1651  sarcosine oxidase gamma subunit  33.59 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1580  Sarcosine oxidase gamma subunit  34.33 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2481  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.09 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4035  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.09 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1933  Sarcosine oxidase gamma subunit  34.35 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3778  sarcosine oxidase gamma subunit  30 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269051  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2749  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  31.58 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5743  hypothetical protein  42.17 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0936885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0942  sarcosine oxidase, gamma subunit  29.61 
 
 		 176 aa  62  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3390  Sarcosine oxidase gamma subunit  33.6 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3657  sarcosine oxidase, gamma subunit family  30.64 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4672  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3355  sarcosine oxidase, gamma subunit family  31.43 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1946  sarcosine oxidase, gamma subunit  29.14 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0488  sarcosine oxidase gamma subunit  41.94 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4703  sarcosine oxidase gamma subunit  27.97 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426146  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0995  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.54 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0903672  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3994  Sarcosine oxidase gamma subunit  29.19 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0972  sarcosine oxidase, gamma subunit  25.88 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4049  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.86 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5632  Sarcosine oxidase gamma subunit  36.36 
 
 		 181 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4034  Sarcosine oxidase gamma subunit  29.19 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.484424 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2187  sarcosine oxidase, gamma subunit  28.57 
 
 		 171 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3739  sarcosine oxidase gamma subunit  31.45 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319491  normal  0.115073 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1873  sarcosine oxidase, gamma subunit  29.22 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.508679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2114  putative sarcosine oxidase, gamma subunit  28.24 
 
 		 176 aa  49.3  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.52218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0162  sarcosine oxidase, gamma subunit  38.98 
 
 		 64 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7230  Sarcosine oxidase gamma subunit  33.33 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0171161  normal  0.102806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0594  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.88 
 
 		 182 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3378  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  25.15 
 
 		 183 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8587  Sarcosine oxidase gamma subunit  32.12 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661189  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2144  sarcosine oxidase, gamma subunit  28.15 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2484  sarcosine oxidase gamma subunit  30.91 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2363  sarcosine oxidase gamma subunit  30.72 
 
 		 153 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1348  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.01 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950834  normal  0.0205544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  30.86 
 
 		 381 aa  42.4  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3448  sarcosine oxidase, gamma subunit  25.25 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3286  sarcosine oxidase gamma subunit  33.8 
 
 		 177 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>