65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4703 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4703  sarcosine oxidase gamma subunit  100 
 
 		 201 aa  387  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426146  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1580  Sarcosine oxidase gamma subunit  43.78 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1651  sarcosine oxidase gamma subunit  41.9 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1933  Sarcosine oxidase gamma subunit  41.53 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1144  sarcosine oxidase, gamma subunit  39.33 
 
 		 193 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1946  sarcosine oxidase, gamma subunit  37.5 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2363  sarcosine oxidase gamma subunit  39.47 
 
 		 153 aa  87.8  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2639  Sarcosine oxidase gamma subunit  32.46 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3859  sarcosine oxidase, gamma subunit  36.5 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0271075  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3355  sarcosine oxidase, gamma subunit family  35.21 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3657  sarcosine oxidase, gamma subunit family  35.26 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4672  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1001  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  28.18 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3701  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.94 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5743  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0936885  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4128  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  28.57 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5632  Sarcosine oxidase gamma subunit  35.65 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3286  sarcosine oxidase gamma subunit  30.09 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3592  Sarcosine oxidase  26.39 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0594  sarcosine oxidase, gamma subunit  32.89 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2757  sarcosine oxidase gamma subunit  25.17 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4035  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.24 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2481  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.24 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5148  sarcosine oxidase, gamma subunit  29.32 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0488595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2749  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  31.89 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5131  sarcosine oxidase gamma subunit  29.32 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3219  sarcosine oxidase, gamma subunit  29.32 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5051  Sarcosine oxidase gamma subunit  29.84 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247837 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0972  sarcosine oxidase, gamma subunit  35.45 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7230  Sarcosine oxidase gamma subunit  37.5 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0171161  normal  0.102806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1597  sarcosine oxidase, gamma subunit  29.03 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4716  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  26.32 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4906  sarcosine oxidase, gamma subunit  36.8 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.167294 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3507  sarcosine oxidase gamma subunit  27.27 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1104  sarcosine oxidase subunit gamma  27.97 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0457  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.45 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3330  sarcosine oxidase gamma subunit  27.27 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621341 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5066  sarcosine oxidase gamma subunit  28.8 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.586483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3778  sarcosine oxidase gamma subunit  30.38 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269051  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0999  sarcosine oxidase subunit gamma  28.81 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4543  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.97 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0489  sarcosine oxidase, gamma subunit  27.2 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2880  Sarcosine oxidase gamma subunit  31.62 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0392  sarcosine oxidase gamma subunit  31.13 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0348  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  25 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0326  sarcosine oxidase, gamma subunit family  25 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0654749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71510  sarcosine oxidase gamma subunit  27.12 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6207  sarcosine oxidase subunit gamma  27.12 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3448  sarcosine oxidase, gamma subunit  38.03 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1951  sarcosine oxidase gamma subunit  30.56 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5204  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  24.79 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0349  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  24.14 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360839  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4881  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  23.12 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.528433 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0049  sarcosine oxidase subunit gamma  27.2 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.507753 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1859  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.19 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76541  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18840  sarcosine oxidase gamma subunit  27.65 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2263  putative sarcosine oxidase  44.44 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1348  sarcosine oxidase, gamma subunit  33.75 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950834  normal  0.0205544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2690  putative sarcosine oxidase gamma subunit  32.5 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2484  sarcosine oxidase gamma subunit  33.77 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1873  sarcosine oxidase, gamma subunit  33.33 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.508679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0304  sarcosine oxidase gamma subunit  28.85 
 
 		 180 aa  42  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3390  Sarcosine oxidase gamma subunit  32.26 
 
 		 199 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0995  sarcosine oxidase, gamma subunit  28.7 
 
 		 186 aa  42  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0903672  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2144  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.95 
 
 		 185 aa  42  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3378  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  26.47 
 
 		 183 aa  41.2  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>