48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1873 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1873  sarcosine oxidase, gamma subunit  100 
 
 		 185 aa  366  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.508679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1348  sarcosine oxidase, gamma subunit  84.86 
 
 		 185 aa  317  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950834  normal  0.0205544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2690  putative sarcosine oxidase gamma subunit  84.32 
 
 		 185 aa  315  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0972  sarcosine oxidase, gamma subunit  44.32 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0516  sarcosine oxidase, gamma subunit  50.29 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2187  sarcosine oxidase, gamma subunit  44.72 
 
 		 171 aa  124  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5204  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  32.26 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1001  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  33.33 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4716  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  29.73 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0457  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.53 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4049  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.67 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4128  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  29.46 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0349  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  27.42 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360839  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4881  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  28.23 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.528433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0348  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  27.42 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0326  sarcosine oxidase, gamma subunit family  27.42 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0654749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6207  sarcosine oxidase subunit gamma  31.25 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71510  sarcosine oxidase gamma subunit  31.25 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1597  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.88 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5051  Sarcosine oxidase gamma subunit  26.11 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247837 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3592  Sarcosine oxidase  29.22 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3859  sarcosine oxidase, gamma subunit  29.52 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0271075  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5066  sarcosine oxidase gamma subunit  25.3 
 
 		 209 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.586483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0489  sarcosine oxidase, gamma subunit  25.88 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2749  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  31.85 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4543  sarcosine oxidase, gamma subunit  25.3 
 
 		 209 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0995  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.58 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0903672  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5131  sarcosine oxidase gamma subunit  25.3 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3507  sarcosine oxidase gamma subunit  25.88 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0392  sarcosine oxidase gamma subunit  26.36 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3330  sarcosine oxidase gamma subunit  25 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3619  Sarcosine oxidase gamma subunit  37.68 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.340515  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2484  sarcosine oxidase gamma subunit  35.65 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3994  Sarcosine oxidase gamma subunit  28.65 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0999  sarcosine oxidase subunit gamma  26.55 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5148  sarcosine oxidase, gamma subunit  24.7 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0488595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3657  sarcosine oxidase, gamma subunit family  29.29 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4672  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0942  sarcosine oxidase, gamma subunit  34.82 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2757  sarcosine oxidase gamma subunit  28.85 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3219  sarcosine oxidase, gamma subunit  24.7 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0594  sarcosine oxidase, gamma subunit  32.54 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3701  sarcosine oxidase, gamma subunit  36.11 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1651  sarcosine oxidase gamma subunit  29.29 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3390  Sarcosine oxidase gamma subunit  29.45 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3739  sarcosine oxidase gamma subunit  32.54 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319491  normal  0.115073 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4034  Sarcosine oxidase gamma subunit  32.03 
 
 		 196 aa  42  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.484424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4703  sarcosine oxidase gamma subunit  33.13 
 
 		 201 aa  41.6  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426146  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8587  Sarcosine oxidase gamma subunit  33.04 
 
 		 171 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>