68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3994 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3994  Sarcosine oxidase gamma subunit  100 
 
 		 196 aa  387  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4034  Sarcosine oxidase gamma subunit  92.82 
 
 		 196 aa  361  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.484424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3739  sarcosine oxidase gamma subunit  92.31 
 
 		 196 aa  345  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319491  normal  0.115073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3390  Sarcosine oxidase gamma subunit  65.08 
 
 		 199 aa  253  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2484  sarcosine oxidase gamma subunit  65.45 
 
 		 197 aa  236  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0866  sarcosine oxidase gamma subunit  54.22 
 
 		 179 aa  131  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3657  sarcosine oxidase, gamma subunit family  48.33 
 
 		 182 aa  120  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4672  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2749  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  48.78 
 
 		 184 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3355  sarcosine oxidase, gamma subunit family  51.8 
 
 		 182 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3778  sarcosine oxidase gamma subunit  46.25 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269051  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0995  sarcosine oxidase, gamma subunit  43.31 
 
 		 186 aa  106  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0903672  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0232  sarcosine oxidase, gamma subunit  39.13 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0304  sarcosine oxidase gamma subunit  38.04 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2114  putative sarcosine oxidase, gamma subunit  35.67 
 
 		 176 aa  90.9  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.52218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8587  Sarcosine oxidase gamma subunit  39.29 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661189  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1104  sarcosine oxidase subunit gamma  38.46 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0489  sarcosine oxidase, gamma subunit  37.69 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18840  sarcosine oxidase gamma subunit  38.19 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0049  sarcosine oxidase subunit gamma  36.92 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.507753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3330  sarcosine oxidase gamma subunit  36.22 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0594  sarcosine oxidase, gamma subunit  34.55 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3507  sarcosine oxidase gamma subunit  36.92 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5131  sarcosine oxidase gamma subunit  35.38 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3219  sarcosine oxidase, gamma subunit  35.38 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5148  sarcosine oxidase, gamma subunit  35.38 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0488595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4128  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  31.55 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5204  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  30.54 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0457  sarcosine oxidase, gamma subunit  33.57 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3701  sarcosine oxidase, gamma subunit  35.43 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5066  sarcosine oxidase gamma subunit  36.13 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.586483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4543  sarcosine oxidase, gamma subunit  36.13 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1001  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  34.06 
 
 		 219 aa  62  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4716  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  32.87 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1951  sarcosine oxidase gamma subunit  37.29 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1859  sarcosine oxidase, gamma subunit  37.29 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76541  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0392  sarcosine oxidase gamma subunit  37.29 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3859  sarcosine oxidase, gamma subunit  35.81 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0271075  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5051  Sarcosine oxidase gamma subunit  34.11 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247837 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0999  sarcosine oxidase subunit gamma  33.9 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4881  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  29.17 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.528433 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2757  sarcosine oxidase gamma subunit  30.6 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2880  Sarcosine oxidase gamma subunit  31.36 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1597  sarcosine oxidase, gamma subunit  33.33 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6207  sarcosine oxidase subunit gamma  28.36 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3592  Sarcosine oxidase  29.19 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71510  sarcosine oxidase gamma subunit  28.36 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0349  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  27.98 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360839  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1580  Sarcosine oxidase gamma subunit  35.14 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0326  sarcosine oxidase, gamma subunit family  27.98 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0654749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0348  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  27.98 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3619  Sarcosine oxidase gamma subunit  36.26 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.340515  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4827  sarcosine oxidase, gamma subunit  34.31 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.880444  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5632  Sarcosine oxidase gamma subunit  29.84 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2690  putative sarcosine oxidase gamma subunit  31.25 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1933  Sarcosine oxidase gamma subunit  32.35 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0972  sarcosine oxidase, gamma subunit  27.16 
 
 		 189 aa  48.5  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1348  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.63 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950834  normal  0.0205544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1651  sarcosine oxidase gamma subunit  34.11 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4035  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.85 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1946  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.58 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2481  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.85 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1873  sarcosine oxidase, gamma subunit  28.65 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.508679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2639  Sarcosine oxidase gamma subunit  26.95 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7230  Sarcosine oxidase gamma subunit  32.86 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0171161  normal  0.102806 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3286  sarcosine oxidase gamma subunit  30.84 
 
 		 177 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2363  sarcosine oxidase gamma subunit  28.44 
 
 		 153 aa  42  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 823 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2187  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.77 
 
 		 171 aa  41.6  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>