57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4049 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4049  sarcosine oxidase, gamma subunit  100 
 
 		 218 aa  431  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4881  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  35.57 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.528433 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2481  sarcosine oxidase, gamma subunit  33.5 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4035  sarcosine oxidase, gamma subunit  33.5 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0348  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  34.54 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0326  sarcosine oxidase, gamma subunit family  34.54 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0654749 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1001  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  38.07 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0349  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  34.54 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360839  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4128  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  35.05 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71510  sarcosine oxidase gamma subunit  38.1 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6207  sarcosine oxidase subunit gamma  38.1 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3330  sarcosine oxidase gamma subunit  37.2 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0457  sarcosine oxidase, gamma subunit  34.5 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4716  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  33.5 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5204  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  31.91 
 
 		 210 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5051  Sarcosine oxidase gamma subunit  34.21 
 
 		 218 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247837 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1597  sarcosine oxidase, gamma subunit  36.9 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3507  sarcosine oxidase gamma subunit  33.92 
 
 		 210 aa  91.3  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1104  sarcosine oxidase subunit gamma  34.34 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0999  sarcosine oxidase subunit gamma  33.33 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0489  sarcosine oxidase, gamma subunit  32.75 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1951  sarcosine oxidase gamma subunit  33.93 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5066  sarcosine oxidase gamma subunit  32.75 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.586483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1859  sarcosine oxidase, gamma subunit  33.33 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76541  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0392  sarcosine oxidase gamma subunit  33.93 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0049  sarcosine oxidase subunit gamma  33.33 
 
 		 210 aa  84.7  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.507753 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4543  sarcosine oxidase, gamma subunit  32.16 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3219  sarcosine oxidase, gamma subunit  32.16 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5148  sarcosine oxidase, gamma subunit  32.16 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0488595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5131  sarcosine oxidase gamma subunit  32.16 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2757  sarcosine oxidase gamma subunit  30.85 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4827  sarcosine oxidase, gamma subunit  33.33 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.880444  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2690  putative sarcosine oxidase gamma subunit  32.5 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3859  sarcosine oxidase, gamma subunit  37.88 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0271075  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1348  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.87 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950834  normal  0.0205544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3701  sarcosine oxidase, gamma subunit  33.82 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18840  sarcosine oxidase gamma subunit  32.05 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2749  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  31.69 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1946  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.22 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1873  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.67 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.508679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3355  sarcosine oxidase, gamma subunit family  27.07 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0232  sarcosine oxidase, gamma subunit  27.53 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3592  Sarcosine oxidase  30.86 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3657  sarcosine oxidase, gamma subunit family  27.12 
 
 		 182 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4672  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2187  sarcosine oxidase, gamma subunit  28.12 
 
 		 171 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2114  putative sarcosine oxidase, gamma subunit  30.23 
 
 		 176 aa  47.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.52218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3778  sarcosine oxidase gamma subunit  27.81 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269051  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2639  Sarcosine oxidase gamma subunit  28.5 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0972  sarcosine oxidase, gamma subunit  27.67 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0995  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.17 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0903672  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0304  sarcosine oxidase gamma subunit  25.17 
 
 		 180 aa  45.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1144  sarcosine oxidase, gamma subunit  28 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1996  glycine cleavage system T protein  25.39 
 
 		 367 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.672194  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3390  Sarcosine oxidase gamma subunit  28.32 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2880  Sarcosine oxidase gamma subunit  29.58 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1651  sarcosine oxidase gamma subunit  26.44 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1580  Sarcosine oxidase gamma subunit  28.34 
 
 		 209 aa  41.6  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>