50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2639 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2639  Sarcosine oxidase gamma subunit  100 
 
 		 209 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1144  sarcosine oxidase, gamma subunit  37.63 
 
 		 193 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1946  sarcosine oxidase, gamma subunit  33.15 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4703  sarcosine oxidase gamma subunit  32.46 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426146  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1580  Sarcosine oxidase gamma subunit  33.66 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0489  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.58 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1104  sarcosine oxidase subunit gamma  31.58 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5131  sarcosine oxidase gamma subunit  31.58 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3219  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.58 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5148  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.58 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0488595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3330  sarcosine oxidase gamma subunit  30.26 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621341 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3507  sarcosine oxidase gamma subunit  30.92 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5066  sarcosine oxidase gamma subunit  30.26 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.586483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4543  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.26 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1933  Sarcosine oxidase gamma subunit  34.81 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0999  sarcosine oxidase subunit gamma  31.58 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0049  sarcosine oxidase subunit gamma  30.26 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.507753 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1597  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.13 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1651  sarcosine oxidase gamma subunit  32.69 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5051  Sarcosine oxidase gamma subunit  30.46 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247837 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0392  sarcosine oxidase gamma subunit  31.03 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1951  sarcosine oxidase gamma subunit  31.03 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5743  hypothetical protein  37.19 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0936885  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1859  sarcosine oxidase, gamma subunit  29.61 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76541  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2757  sarcosine oxidase gamma subunit  26.49 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2363  sarcosine oxidase gamma subunit  32.67 
 
 		 153 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5632  Sarcosine oxidase gamma subunit  42.39 
 
 		 181 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7230  Sarcosine oxidase gamma subunit  43.21 
 
 		 181 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0171161  normal  0.102806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4049  sarcosine oxidase, gamma subunit  27.98 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3657  sarcosine oxidase, gamma subunit family  35.17 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4672  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4034  Sarcosine oxidase gamma subunit  31.07 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.484424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3390  Sarcosine oxidase gamma subunit  29.44 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3286  sarcosine oxidase gamma subunit  31.3 
 
 		 177 aa  48.9  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1001  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  30 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3355  sarcosine oxidase, gamma subunit family  32.64 
 
 		 182 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0349  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  28.03 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360839  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3859  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.65 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0271075  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0348  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  27.39 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0326  sarcosine oxidase, gamma subunit family  27.39 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0654749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4827  sarcosine oxidase, gamma subunit  29.37 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.880444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4881  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  27.45 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.528433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3994  Sarcosine oxidase gamma subunit  28.99 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3778  sarcosine oxidase gamma subunit  33.56 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269051  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4128  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  29.23 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2880  Sarcosine oxidase gamma subunit  33.61 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3739  sarcosine oxidase gamma subunit  30.86 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319491  normal  0.115073 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2144  sarcosine oxidase, gamma subunit  35.37 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6207  sarcosine oxidase subunit gamma  29.55 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71510  sarcosine oxidase gamma subunit  29.55 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5204  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  27.74 
 
 		 210 aa  42  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>