49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0232 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0232  sarcosine oxidase, gamma subunit  100 
 
 		 184 aa  371  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0304  sarcosine oxidase gamma subunit  80 
 
 		 180 aa  298  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2114  putative sarcosine oxidase, gamma subunit  47.13 
 
 		 176 aa  144  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.52218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0594  sarcosine oxidase, gamma subunit  41.18 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4034  Sarcosine oxidase gamma subunit  40.59 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.484424 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8587  Sarcosine oxidase gamma subunit  40.91 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661189  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3994  Sarcosine oxidase gamma subunit  39.13 
 
 		 196 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3390  Sarcosine oxidase gamma subunit  34.71 
 
 		 199 aa  99  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3739  sarcosine oxidase gamma subunit  39.16 
 
 		 196 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319491  normal  0.115073 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2749  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  33.14 
 
 		 184 aa  91.3  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2484  sarcosine oxidase gamma subunit  35.91 
 
 		 197 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3355  sarcosine oxidase, gamma subunit family  35.37 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3657  sarcosine oxidase, gamma subunit family  32.4 
 
 		 182 aa  85.1  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4672  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0995  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.82 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0903672  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3778  sarcosine oxidase gamma subunit  34.42 
 
 		 188 aa  77  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269051  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1104  sarcosine oxidase subunit gamma  32.19 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0866  sarcosine oxidase gamma subunit  30.43 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4716  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  29.14 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2757  sarcosine oxidase gamma subunit  28.66 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4881  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  27.81 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.528433 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0049  sarcosine oxidase subunit gamma  31.82 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.507753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71510  sarcosine oxidase gamma subunit  28.47 
 
 		 211 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4128  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  27.27 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6207  sarcosine oxidase subunit gamma  28.47 
 
 		 211 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0457  sarcosine oxidase, gamma subunit  27.97 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0349  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  26.49 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360839  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5204  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  27.97 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3507  sarcosine oxidase gamma subunit  28.08 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0348  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  27.15 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0326  sarcosine oxidase, gamma subunit family  27.15 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0654749 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2481  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.35 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4035  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.35 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0489  sarcosine oxidase, gamma subunit  27.4 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4049  sarcosine oxidase, gamma subunit  27.53 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.343929 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3330  sarcosine oxidase gamma subunit  27.07 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621341 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1951  sarcosine oxidase gamma subunit  27.59 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5066  sarcosine oxidase gamma subunit  26.03 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.586483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0392  sarcosine oxidase gamma subunit  27.59 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3701  sarcosine oxidase, gamma subunit  29.08 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18840  sarcosine oxidase gamma subunit  26.84 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1859  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.9 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3859  sarcosine oxidase, gamma subunit  29.45 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0271075  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5131  sarcosine oxidase gamma subunit  27.4 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4543  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.03 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0999  sarcosine oxidase subunit gamma  25.52 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5051  Sarcosine oxidase gamma subunit  28.17 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247837 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3219  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.9 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5148  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.9 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0488595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4827  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.81 
 
 		 217 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.880444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>