53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0594 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0594  sarcosine oxidase, gamma subunit  100 
 
 		 182 aa  361  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2114  putative sarcosine oxidase, gamma subunit  43.79 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.52218  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0232  sarcosine oxidase, gamma subunit  41.18 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8587  Sarcosine oxidase gamma subunit  38.32 
 
 		 171 aa  108  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661189  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0304  sarcosine oxidase gamma subunit  36.6 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2749  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  34.42 
 
 		 184 aa  91.7  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3355  sarcosine oxidase, gamma subunit family  33.13 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0995  sarcosine oxidase, gamma subunit  35.54 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0903672  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3657  sarcosine oxidase, gamma subunit family  29.82 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4672  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3778  sarcosine oxidase gamma subunit  33.93 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269051  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3994  Sarcosine oxidase gamma subunit  34.55 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4034  Sarcosine oxidase gamma subunit  33.55 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.621132  normal  0.484424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3859  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.68 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0271075  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3739  sarcosine oxidase gamma subunit  31.62 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.319491  normal  0.115073 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1597  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.9 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5051  Sarcosine oxidase gamma subunit  31.29 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3390  Sarcosine oxidase gamma subunit  30.25 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4703  sarcosine oxidase gamma subunit  33.33 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426146  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0972  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.25 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4128  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  30.12 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0866  sarcosine oxidase gamma subunit  32.42 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0457  sarcosine oxidase, gamma subunit  27.71 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2484  sarcosine oxidase gamma subunit  31.13 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.375094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4716  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  27.11 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3330  sarcosine oxidase gamma subunit  25.93 
 
 		 216 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621341 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1104  sarcosine oxidase subunit gamma  27.01 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4881  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  27.03 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.528433 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2690  putative sarcosine oxidase gamma subunit  32.33 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1580  Sarcosine oxidase gamma subunit  31.47 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18840  sarcosine oxidase gamma subunit  28.57 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3592  Sarcosine oxidase  26.88 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1348  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.58 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.950834  normal  0.0205544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0349  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  26.35 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.360839  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2481  sarcosine oxidase, gamma subunit  24.31 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4035  sarcosine oxidase, gamma subunit  24.31 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3507  sarcosine oxidase gamma subunit  23.81 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3701  sarcosine oxidase, gamma subunit  25.74 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0326  sarcosine oxidase, gamma subunit family  25.68 
 
 		 210 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0654749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0348  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  25.68 
 
 		 210 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.448835 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0392  sarcosine oxidase gamma subunit  25 
 
 		 211 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0049  sarcosine oxidase subunit gamma  26.76 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.507753 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1951  sarcosine oxidase gamma subunit  25.62 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0489  sarcosine oxidase, gamma subunit  24.87 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1873  sarcosine oxidase, gamma subunit  32.54 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.508679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5204  sarcosine oxidase, gamma subunit, heterotetrameric  23.16 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0999  sarcosine oxidase subunit gamma  25.71 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1651  sarcosine oxidase gamma subunit  30.14 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1859  sarcosine oxidase, gamma subunit  24.29 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76541  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71510  sarcosine oxidase gamma subunit  24.66 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6207  sarcosine oxidase subunit gamma  24.66 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2187  sarcosine oxidase, gamma subunit  26.62 
 
 		 171 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1001  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  30.2 
 
 		 219 aa  41.6  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5066  sarcosine oxidase gamma subunit  23.56 
 
 		 209 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.586483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>