40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3448 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3448  sarcosine oxidase, gamma subunit  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2144  sarcosine oxidase, gamma subunit  43.82 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2263  putative sarcosine oxidase  41.92 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1933  Sarcosine oxidase gamma subunit  36.03 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1651  sarcosine oxidase gamma subunit  36.03 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1580  Sarcosine oxidase gamma subunit  35.56 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5743  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0936885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2363  sarcosine oxidase gamma subunit  36.26 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7230  Sarcosine oxidase gamma subunit  34.78 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0171161  normal  0.102806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1946  sarcosine oxidase, gamma subunit  27.81 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2187  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.87 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5632  Sarcosine oxidase gamma subunit  32.43 
 
 		 181 aa  51.6  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0972  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.93 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4906  sarcosine oxidase, gamma subunit  28.79 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.167294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4703  sarcosine oxidase gamma subunit  38.03 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426146  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0049  sarcosine oxidase subunit gamma  33.33 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.507753 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0995  sarcosine oxidase, gamma subunit  34.29 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0903672  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1104  sarcosine oxidase subunit gamma  33.33 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3330  sarcosine oxidase gamma subunit  38.03 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.621341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0489  sarcosine oxidase, gamma subunit  31.48 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1951  sarcosine oxidase gamma subunit  38.03 
 
 		 201 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0392  sarcosine oxidase gamma subunit  38.03 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3859  sarcosine oxidase, gamma subunit  25.84 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0271075  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5051  Sarcosine oxidase gamma subunit  34.57 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247837 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1859  sarcosine oxidase, gamma subunit  37.14 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.76541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2880  Sarcosine oxidase gamma subunit  33.05 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3657  sarcosine oxidase, gamma subunit family  27.2 
 
 		 182 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4672  normal  0.226521 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0999  sarcosine oxidase subunit gamma  35.21 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3378  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  25.79 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3507  sarcosine oxidase gamma subunit  31.48 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18840  sarcosine oxidase gamma subunit  29.17 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5131  sarcosine oxidase gamma subunit  30.77 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3355  sarcosine oxidase, gamma subunit family  32.11 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3219  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.77 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5148  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.77 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0488595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2749  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  26.58 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1597  sarcosine oxidase, gamma subunit  32.1 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3778  sarcosine oxidase gamma subunit  31.71 
 
 		 188 aa  42.4  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3592  Sarcosine oxidase  25.25 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0942  sarcosine oxidase, gamma subunit  35.11 
 
 		 176 aa  42  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>