15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4906 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4906  sarcosine oxidase, gamma subunit  100 
 
 		 188 aa  367  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.167294 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3378  sarcosine oxidase gamma subunit family protein  38.8 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1946  sarcosine oxidase, gamma subunit  34.08 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.854686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1144  sarcosine oxidase, gamma subunit  35.71 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4703  sarcosine oxidase gamma subunit  34.16 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.426146  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5743  hypothetical protein  34.88 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0936885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1933  Sarcosine oxidase gamma subunit  35.77 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00979813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1651  sarcosine oxidase gamma subunit  35.77 
 
 		 209 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3448  sarcosine oxidase, gamma subunit  30.3 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1580  Sarcosine oxidase gamma subunit  35.48 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2144  sarcosine oxidase, gamma subunit  27.22 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.945711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3701  sarcosine oxidase, gamma subunit  27.5 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2880  Sarcosine oxidase gamma subunit  29.94 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2363  sarcosine oxidase gamma subunit  30.87 
 
 		 153 aa  42  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5632  Sarcosine oxidase gamma subunit  28.57 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>