97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0847 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0847  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  100 
 
 
144 aa  302  9.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.687312 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  41.05 
 
 
335 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.19 
 
 
221 aa  70.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4623  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  39.47 
 
 
257 aa  60.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179388  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.29 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0516  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.73 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.28 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.83 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0644  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40.79 
 
 
226 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.143261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0612  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.04 
 
 
263 aa  52.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  29.37 
 
 
154 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0603  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40.79 
 
 
220 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112924  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.7 
 
 
524 aa  51.6  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.95 
 
 
204 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.33 
 
 
251 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.33 
 
 
251 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.62 
 
 
126 aa  50.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.34 
 
 
279 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.59 
 
 
181 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.96 
 
 
279 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.29 
 
 
273 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.67 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.7 
 
 
181 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2320  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.18 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.18 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.68 
 
 
266 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2343  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.18 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  25.62 
 
 
281 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1286  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.25 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.246125  normal  0.28961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3302  hypothetical protein  36.11 
 
 
179 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0761077  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2359  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.7 
 
 
181 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.714187  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  43.14 
 
 
197 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1244  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36 
 
 
183 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2767  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.57 
 
 
151 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795518  normal  0.509159 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.71 
 
 
165 aa  47  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3439  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.59 
 
 
258 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1558  putative heat shock protein  32.89 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0443108  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.55 
 
 
478 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  29.55 
 
 
478 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1563  heat-inducible protein  30.28 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.72 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2900  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.58 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456772  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.52 
 
 
351 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.88 
 
 
234 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0694  hypothetical protein  33.33 
 
 
246 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00754314  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  45.1 
 
 
134 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3801  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.27 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2000  heat-inducible protein  26.67 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1616  heat-inducible protein  26.67 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2266  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.67 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221661  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01363  hypothetical protein  26.67 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1773  heat-inducible protein  26.67 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2276  heat-inducible protein  26.67 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0863  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  31.96 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01351  heat-inducible protein  26.67 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1466  heat-inducible protein  26.67 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  46 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  46 
 
 
134 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  46 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.47 
 
 
305 aa  42.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.32 
 
 
283 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4560  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  25.84 
 
 
284 aa  42.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98407  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  28.16 
 
 
157 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0137  hypothetical protein  26.09 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000209855  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.11 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2782  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.17 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.3452  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2405  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437003  hitchhiker  0.00230018 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0957  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.17 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0706  hypothetical protein  30.85 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482756 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04470  hypothetical protein  32.35 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.1707  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.2 
 
 
278 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.07 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0590  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.42 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.927794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.57 
 
 
397 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.18 
 
 
282 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4760  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.54 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  44 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.39 
 
 
354 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2944  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.1 
 
 
154 aa  42  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  36.11 
 
 
269 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.25 
 
 
241 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1980  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.09 
 
 
149 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  38.89 
 
 
275 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0543  conserved hypothetical META domain lipoprotein  27.68 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0744  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.65 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0787  heat shock protein  26.28 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0351684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4523  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.82 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207196  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  31.51 
 
 
187 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0316  hypothetical protein  36 
 
 
182 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1194  hypothetical protein  36 
 
 
182 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1923  hypothetical protein  36 
 
 
182 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.87534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0275  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  25.62 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0221  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.41 
 
 
484 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.057348  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1186  hypothetical protein  36 
 
 
182 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323907  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1033  hypothetical protein  36 
 
 
182 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.365055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0834  hypothetical protein  36 
 
 
182 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1348  hypothetical protein  36 
 
 
224 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>