104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1254 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  100 
 
 		 151 aa  299  8.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2944  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  47.48 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  52.43 
 
 		 267 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  51.46 
 
 		 267 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  50.49 
 
 		 297 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0590  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  50 
 
 		 140 aa  93.6  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.927794 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  44.86 
 
 		 241 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  44.44 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0863  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  34.59 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  34.86 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1558  putative heat shock protein  35.63 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0443108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.75 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  48.05 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.9 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.28 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  37.5 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  38.68 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.37 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.04 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1135  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40.45 
 
 		 234 aa  64.3  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.566591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1980  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  45.22 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  38.3 
 
 		 524 aa  63.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.04 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2767  hypothetical protein  35.45 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0744  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.71 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.78 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.93 
 
 		 273 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0612  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.93 
 
 		 263 aa  60.5  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.2 
 
 		 397 aa  58.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0769  hypothetical protein  30.28 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0776  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.33 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0867  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.64 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  33.09 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1689  lipoprotein, putative  29.63 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02640  probable secreted protein containing HslJ-like protein  30.36 
 
 		 274 aa  57  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0641  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3548  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.17 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3670  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.36 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.141959 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  47.54 
 
 		 365 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3479  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.36 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.65 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.71 
 
 		 279 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0923  hypothetical protein  29.75 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0765  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.28 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3258  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.28 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0864  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.2 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.847217  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.36 
 
 		 251 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.36 
 
 		 251 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3361  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.28 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3439  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.36 
 
 		 258 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0603  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  48.15 
 
 		 220 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2857  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0194304 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.86 
 
 		 204 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  34.72 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0644  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  46.3 
 
 		 226 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.143261 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.69 
 
 		 478 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  34.69 
 
 		 478 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0847  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.67 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.687312 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  40 
 
 		 234 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2782  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.18 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.3452  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0516  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  43.4 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52290  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.378524 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  32.29 
 
 		 246 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  42.11 
 
 		 197 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  41.79 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.04 
 
 		 206 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0694  hypothetical protein  31.58 
 
 		 246 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00754314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4760  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  24.81 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3641  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.28 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.97 
 
 		 354 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0221  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.03 
 
 		 484 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.057348  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  49.12 
 
 		 266 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.76 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  40.74 
 
 		 275 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0137  hypothetical protein  24.73 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000209855  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4623  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30 
 
 		 257 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179388  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1816  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.63 
 
 		 242 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1923  hypothetical protein  38.03 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.87534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1033  hypothetical protein  38.03 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.365055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0834  hypothetical protein  38.03 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1186  hypothetical protein  38.03 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1194  hypothetical protein  38.03 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0316  hypothetical protein  38.03 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.99 
 
 		 335 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1348  hypothetical protein  38.03 
 
 		 224 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  38.03 
 
 		 187 aa  42.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  42.62 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.73 
 
 		 283 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3124  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.94 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000058993  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  31.4 
 
 		 281 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.53 
 
 		 279 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.21 
 
 		 282 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2767  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.78 
 
 		 151 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795518  normal  0.509159 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04470  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.1707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  27.84 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  38.89 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0424  hypothetical protein  35.4 
 
 		 239 aa  40.4  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.36269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1244  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  43.14 
 
 		 183 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.5 
 
 		 181 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>