63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1816 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1816  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  100 
 
 		 242 aa  495  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  31.95 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  33.76 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.04 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.04 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5831  hypothetical protein  44.25 
 
 		 126 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0377295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3896  hypothetical protein  44.25 
 
 		 126 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.612405  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4472  hypothetical protein  44.25 
 
 		 126 aa  97.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0695471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4373  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3909  hypothetical protein  51.22 
 
 		 114 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1408  hypothetical protein  43.64 
 
 		 126 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4163  hypothetical protein  53.75 
 
 		 130 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739708 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2466  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2385  hypothetical protein  50 
 
 		 156 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2692  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0920  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  87  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0754  hypothetical protein  50 
 
 		 148 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0107  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29 
 
 		 275 aa  85.5  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0742  hypothetical protein  50 
 
 		 148 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.865339  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1948  hypothetical protein  44.16 
 
 		 93 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.017196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2483  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.84 
 
 		 280 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.897758  normal  0.934589 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1015  proteinase inhibitor I1 Kazal  36.71 
 
 		 343 aa  67  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.14 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.33 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  31.88 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.76 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.43 
 
 		 524 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3124  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.32 
 
 		 143 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000058993  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.56 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1434  hypothetical protein  26.88 
 
 		 284 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  33.02 
 
 		 246 aa  52  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.66 
 
 		 150 aa  52  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.85 
 
 		 279 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5534  hypothetical protein  34.72 
 
 		 193 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.88 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.82 
 
 		 351 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.03 
 
 		 478 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  33.03 
 
 		 478 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0516  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.19 
 
 		 176 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40.28 
 
 		 365 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.17 
 
 		 160 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000168572  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.71 
 
 		 146 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0863  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  32.31 
 
 		 137 aa  46.6  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2782  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.38 
 
 		 152 aa  46.2  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.3452  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0543  conserved hypothetical META domain lipoprotein  28.09 
 
 		 137 aa  45.4  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1375  transcriptional regulator, LysR family  27.27 
 
 		 458 aa  45.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  29.41 
 
 		 135 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2275  hypothetical protein  25.64 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03570  domain of unknown function (306) family  26.11 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101007  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  29.5 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  26.17 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.63 
 
 		 151 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.04 
 
 		 279 aa  43.9  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.43 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  30.23 
 
 		 157 aa  42.7  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  31.33 
 
 		 281 aa  42.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.17 
 
 		 267 aa  42.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.91 
 
 		 153 aa  42.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0445  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.3 
 
 		 162 aa  42.4  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52290  hypothetical protein  31.68 
 
 		 135 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.378524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.93 
 
 		 305 aa  42.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3712  hypothetical protein  34.85 
 
 		 113 aa  42  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.750791  hitchhiker  0.0000649397 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.32 
 
 		 165 aa  42  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>