19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5534 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5534  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  390  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1948  hypothetical protein  42.65 
 
 
93 aa  62  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.017196 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3896  hypothetical protein  47.22 
 
 
126 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.612405  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4472  hypothetical protein  47.22 
 
 
126 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0695471  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5831  hypothetical protein  47.22 
 
 
126 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0377295  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1408  hypothetical protein  42.65 
 
 
126 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4373  hypothetical protein  42.25 
 
 
126 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3909  hypothetical protein  42.25 
 
 
114 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1015  proteinase inhibitor I1 Kazal  38.24 
 
 
343 aa  59.3  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4163  hypothetical protein  39.44 
 
 
130 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.739708 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  36.11 
 
 
269 aa  55.1  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0742  hypothetical protein  40 
 
 
148 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.865339  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2466  hypothetical protein  41.54 
 
 
154 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0754  hypothetical protein  41.54 
 
 
148 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2385  hypothetical protein  41.54 
 
 
156 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2692  hypothetical protein  41.54 
 
 
157 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0920  hypothetical protein  41.54 
 
 
151 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  34.15 
 
 
275 aa  52  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1816  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.78 
 
 
242 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>