29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3909 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3909  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4373  hypothetical protein  93.86 
 
 		 126 aa  220  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5831  hypothetical protein  85.96 
 
 		 126 aa  206  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0377295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3896  hypothetical protein  85.96 
 
 		 126 aa  206  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.612405  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4472  hypothetical protein  85.96 
 
 		 126 aa  206  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0695471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1408  hypothetical protein  82.46 
 
 		 126 aa  201  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4163  hypothetical protein  81.82 
 
 		 130 aa  156  9e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739708 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0742  hypothetical protein  66.23 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.865339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0920  hypothetical protein  64.94 
 
 		 151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2692  hypothetical protein  64.94 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2385  hypothetical protein  64.94 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2466  hypothetical protein  64.94 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0754  hypothetical protein  64.94 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1816  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  51.22 
 
 		 242 aa  95.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  50 
 
 		 275 aa  94.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1948  hypothetical protein  50.62 
 
 		 93 aa  94.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.017196 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  52.56 
 
 		 269 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  46.38 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  43.48 
 
 		 251 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  43.48 
 
 		 251 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1015  proteinase inhibitor I1 Kazal  36.25 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5534  hypothetical protein  42.25 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2483  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.41 
 
 		 280 aa  53.9  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.897758  normal  0.934589 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1194  hypothetical protein  26.61 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00135563  normal  0.454518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3712  hypothetical protein  40.91 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.750791  hitchhiker  0.0000649397 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1197  hypothetical protein  25.81 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.545416  normal  0.0460132 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0107  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.01 
 
 		 275 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1256  hypothetical protein  24.19 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000147091  hitchhiker  0.00456123 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0803  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.12 
 
 		 221 aa  40.4  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>