20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2483 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2483  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  100 
 
 
280 aa  586  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.897758  normal  0.934589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0107  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  46.75 
 
 
275 aa  208  7e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03570  domain of unknown function (306) family  32.73 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101007  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0670  hypothetical protein  33.88 
 
 
295 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.160004  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0698  hypothetical protein  34.92 
 
 
299 aa  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1434  hypothetical protein  29.91 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1816  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.72 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  29.41 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.78 
 
 
221 aa  59.7  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4373  hypothetical protein  32.41 
 
 
126 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3909  hypothetical protein  32.41 
 
 
114 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4472  hypothetical protein  33.03 
 
 
126 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0695471  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3896  hypothetical protein  33.03 
 
 
126 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.612405  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5831  hypothetical protein  33.03 
 
 
126 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0377295  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  22.65 
 
 
251 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1408  hypothetical protein  30.77 
 
 
126 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  22.65 
 
 
251 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  25.68 
 
 
275 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4163  hypothetical protein  31.46 
 
 
130 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.739708 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1948  hypothetical protein  30.67 
 
 
93 aa  42.7  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.017196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>