51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0107 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0107  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  100 
 
 
275 aa  566  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2483  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  42.46 
 
 
280 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.897758  normal  0.934589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03570  domain of unknown function (306) family  39.73 
 
 
265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101007  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1434  hypothetical protein  36.65 
 
 
284 aa  126  3e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0698  hypothetical protein  29.25 
 
 
299 aa  99  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0670  hypothetical protein  29.32 
 
 
295 aa  96.3  5e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.160004  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1816  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29 
 
 
242 aa  85.5  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  27.66 
 
 
269 aa  69.3  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  25.56 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1351  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.01 
 
 
324 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.367419 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2275  hypothetical protein  33.06 
 
 
172 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.77 
 
 
524 aa  59.7  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.9 
 
 
251 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.9 
 
 
251 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0445  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.86 
 
 
162 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.48 
 
 
234 aa  53.5  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0776  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  42.05 
 
 
137 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.91 
 
 
145 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2601  heat-inducible protein  40.43 
 
 
142 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4373  hypothetical protein  35.16 
 
 
126 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2767  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.59 
 
 
151 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795518  normal  0.509159 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0863  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  39.02 
 
 
137 aa  49.7  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4472  hypothetical protein  34.07 
 
 
126 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0695471  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5831  hypothetical protein  34.07 
 
 
126 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0377295  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3896  hypothetical protein  34.07 
 
 
126 aa  49.3  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.612405  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  32.43 
 
 
157 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3909  hypothetical protein  33.01 
 
 
114 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.47 
 
 
148 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1408  hypothetical protein  27.5 
 
 
126 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1135  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.73 
 
 
234 aa  46.2  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.566591  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1558  putative heat shock protein  32.41 
 
 
170 aa  45.8  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0443108  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.35 
 
 
273 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1948  hypothetical protein  39.06 
 
 
93 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.017196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.49 
 
 
152 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0769  hypothetical protein  37.5 
 
 
138 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0744  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  40.24 
 
 
137 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2403  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  42.37 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501935  hitchhiker  0.00570797 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.29 
 
 
221 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3479  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.97 
 
 
138 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3670  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.97 
 
 
138 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.141959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.49 
 
 
150 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3548  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.97 
 
 
138 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1244  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.41 
 
 
183 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2385  hypothetical protein  34.44 
 
 
156 aa  42.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1015  proteinase inhibitor I1 Kazal  33.85 
 
 
343 aa  42.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35 
 
 
351 aa  42.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0742  hypothetical protein  34.44 
 
 
148 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.865339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2692  hypothetical protein  34.44 
 
 
157 aa  42  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0754  hypothetical protein  34.44 
 
 
148 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2466  hypothetical protein  34.44 
 
 
154 aa  42  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0920  hypothetical protein  34.44 
 
 
151 aa  42  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>