34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2601 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2601  heat-inducible protein  100 
 
 
142 aa  290  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1917  heat-inducible protein  58.55 
 
 
150 aa  174  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2211  heat-inducible protein  58.55 
 
 
150 aa  174  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.27688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1807  heat-inducible protein  58.55 
 
 
150 aa  174  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2266  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  46.1 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221661  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01363  hypothetical protein  46.1 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1616  heat-inducible protein  46.1 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1773  heat-inducible protein  46.1 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2276  heat-inducible protein  46.1 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1466  heat-inducible protein  46.1 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01351  heat-inducible protein  46.1 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1563  heat-inducible protein  45.39 
 
 
140 aa  124  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2000  heat-inducible protein  45.39 
 
 
140 aa  122  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1828  heat-inducible protein  44.29 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1691  heat-inducible protein  44.29 
 
 
136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.797199  hitchhiker  0.00277177 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1765  heat-inducible protein  43.57 
 
 
136 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0625871 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1768  heat-inducible protein  43.57 
 
 
136 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0151813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1508  heat-inducible protein  42.86 
 
 
136 aa  114  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2134  heat-inducible protein  43.88 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.567559  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1268  heat shock protein HslJ  34.27 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000183655  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02669  hypothetical protein  31.39 
 
 
147 aa  84  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003792  heat shock protein HslJ  32.89 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000159287  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2085  heat shock protein  34.9 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0202  heat shock protein HslJ  23.65 
 
 
152 aa  60.8  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0388  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.76 
 
 
242 aa  49.7  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0107  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40.43 
 
 
275 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1028  putative lipoprotein  31.73 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.62 
 
 
251 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.62 
 
 
251 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1173  putative lipoprotein  28.57 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.891914  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.64 
 
 
221 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0974  putative lipoprotein  28.57 
 
 
144 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  30.67 
 
 
187 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1351  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.73 
 
 
324 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.367419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>