66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1268 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1268  heat shock protein HslJ  100 
 
 
147 aa  304  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000183655  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003792  heat shock protein HslJ  74.15 
 
 
148 aa  227  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000159287  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02669  hypothetical protein  73.47 
 
 
147 aa  222  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2085  heat shock protein  68.28 
 
 
147 aa  202  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2601  heat-inducible protein  34.27 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2266  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.1 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221661  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01363  hypothetical protein  33.1 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1616  heat-inducible protein  33.1 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1773  heat-inducible protein  33.1 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2276  heat-inducible protein  33.1 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1563  heat-inducible protein  33.1 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1466  heat-inducible protein  33.1 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01351  heat-inducible protein  33.1 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2000  heat-inducible protein  33.1 
 
 
140 aa  84  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0202  heat shock protein HslJ  38.14 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1807  heat-inducible protein  36.07 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2211  heat-inducible protein  36.07 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.27688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1917  heat-inducible protein  36.07 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1765  heat-inducible protein  30.5 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0625871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1508  heat-inducible protein  29.79 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1691  heat-inducible protein  31.11 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.797199  hitchhiker  0.00277177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1768  heat-inducible protein  29.79 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0151813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1828  heat-inducible protein  31.11 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2134  heat-inducible protein  28.57 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.567559  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  32.19 
 
 
281 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0867  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.33 
 
 
137 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0863  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  28.36 
 
 
137 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0776  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.91 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0744  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.58 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3258  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.46 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0765  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.46 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3361  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.46 
 
 
138 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  32.71 
 
 
157 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1351  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.68 
 
 
324 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.367419 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0923  hypothetical protein  30.4 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0864  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.79 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.847217  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.81 
 
 
153 aa  47  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2767  hypothetical protein  29.41 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3124  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  23.91 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000058993  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3548  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.92 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3479  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.92 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.04 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  25.4 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0769  hypothetical protein  34.38 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3670  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.92 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.141959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.5 
 
 
305 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  24.51 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.21 
 
 
274 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  25.23 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30 
 
 
351 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.21 
 
 
280 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  25.23 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.72 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  35.19 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.28 
 
 
241 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  24.14 
 
 
135 aa  42  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.23 
 
 
134 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1689  lipoprotein, putative  33.33 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3302  hypothetical protein  29.23 
 
 
179 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0761077  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2900  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  22.46 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456772  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.38 
 
 
221 aa  40.8  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28 
 
 
126 aa  40.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.33 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2272  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.43 
 
 
169 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494136  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52290  hypothetical protein  31.58 
 
 
135 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.378524 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.23 
 
 
134 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>