52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2900 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2900  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  100 
 
 		 133 aa  266  8e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456772  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  48.15 
 
 		 234 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.43 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1351  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.96 
 
 		 324 aa  57  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.367419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  27.74 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31 
 
 		 524 aa  54.7  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.63 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.07 
 
 		 251 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.07 
 
 		 251 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.36 
 
 		 351 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  33.64 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0847  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.58 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.687312 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.63 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  27.78 
 
 		 281 aa  47  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.85 
 
 		 283 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30 
 
 		 204 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4523  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.58 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207196  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1765  heat-inducible protein  24.8 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0625871 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1768  heat-inducible protein  24.8 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0151813 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2211  heat-inducible protein  22.6 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.27688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1917  heat-inducible protein  22.6 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1508  heat-inducible protein  24.8 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1807  heat-inducible protein  22.6 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0275  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.65 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0744  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1268  heat shock protein HslJ  23.91 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000183655  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  29.91 
 
 		 246 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.55 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.44 
 
 		 279 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0543  conserved hypothetical META domain lipoprotein  26.42 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1563  heat-inducible protein  23.53 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02669  hypothetical protein  23.02 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  29.59 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01363  hypothetical protein  22.79 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2266  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  22.79 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221661  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1828  heat-inducible protein  24.8 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01351  heat-inducible protein  22.79 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0202  heat shock protein HslJ  25.77 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1466  heat-inducible protein  22.79 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1616  heat-inducible protein  22.79 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.89 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1773  heat-inducible protein  22.79 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2276  heat-inducible protein  22.79 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1691  heat-inducible protein  24.8 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.797199  hitchhiker  0.00277177 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2000  heat-inducible protein  22.79 
 
 		 140 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2085  heat shock protein  26.39 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.02 
 
 		 354 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0769  hypothetical protein  28.87 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3124  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.27 
 
 		 143 aa  40.4  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000058993  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1434  hypothetical protein  25.42 
 
 		 284 aa  40.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0670  hypothetical protein  25.25 
 
 		 295 aa  40.4  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.160004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003792  heat shock protein HslJ  22.14 
 
 		 148 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000159287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>