38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2211 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1917  heat-inducible protein  100 
 
 
150 aa  311  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2211  heat-inducible protein  100 
 
 
150 aa  311  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.27688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1807  heat-inducible protein  99.33 
 
 
150 aa  310  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2601  heat-inducible protein  58.55 
 
 
142 aa  174  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1563  heat-inducible protein  45.75 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2266  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  45.75 
 
 
140 aa  127  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221661  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01363  hypothetical protein  45.75 
 
 
140 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1616  heat-inducible protein  45.75 
 
 
140 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1773  heat-inducible protein  45.75 
 
 
140 aa  127  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2276  heat-inducible protein  45.75 
 
 
140 aa  127  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1466  heat-inducible protein  45.75 
 
 
140 aa  127  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01351  heat-inducible protein  45.75 
 
 
140 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2000  heat-inducible protein  45.75 
 
 
140 aa  126  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1765  heat-inducible protein  37.33 
 
 
136 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0625871 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1768  heat-inducible protein  37.33 
 
 
136 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0151813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2134  heat-inducible protein  41.33 
 
 
137 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.567559  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1828  heat-inducible protein  37.33 
 
 
136 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1508  heat-inducible protein  36.67 
 
 
136 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1691  heat-inducible protein  37.33 
 
 
136 aa  106  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.797199  hitchhiker  0.00277177 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02669  hypothetical protein  31.37 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003792  heat shock protein HslJ  33.12 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000159287  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1268  heat shock protein HslJ  36.07 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000183655  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2085  heat shock protein  33.55 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0202  heat shock protein HslJ  25.35 
 
 
152 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1351  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.04 
 
 
324 aa  52  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.367419 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0974  putative lipoprotein  24.34 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1028  putative lipoprotein  23.81 
 
 
144 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1173  putative lipoprotein  24.34 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.891914  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1348  hypothetical protein  32 
 
 
224 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1194  hypothetical protein  32 
 
 
182 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1923  hypothetical protein  32 
 
 
182 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.87534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1033  hypothetical protein  32 
 
 
182 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.365055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0834  hypothetical protein  32 
 
 
182 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0316  hypothetical protein  32 
 
 
182 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1186  hypothetical protein  32 
 
 
182 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  32 
 
 
187 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  22.45 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  25.41 
 
 
154 aa  40  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>