107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1898 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 154 aa  311  2.9999999999999996e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.43 
 
 		 145 aa  84  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  40.19 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.65 
 
 		 273 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.21 
 
 		 524 aa  74.3  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.75 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0744  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.73 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.48 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.77 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.33 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  30.48 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  29.52 
 
 		 297 aa  64.3  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  39.6 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  29.77 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.33 
 
 		 325 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0776  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.95 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.14 
 
 		 279 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2944  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.56 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.71 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.91 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.61 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0863  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  27.66 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.09 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.17 
 
 		 397 aa  57.4  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.24 
 
 		 279 aa  57  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0867  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1375  transcriptional regulator, LysR family  32.32 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  33.03 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1816  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.78 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0137  hypothetical protein  28.36 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000209855  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4560  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.33 
 
 		 284 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2767  hypothetical protein  25.74 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02640  probable secreted protein containing HslJ-like protein  28.99 
 
 		 274 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0847  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.37 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.687312 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0612  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.17 
 
 		 263 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.26 
 
 		 274 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.41 
 
 		 241 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.21 
 
 		 351 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.26 
 
 		 280 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.03 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0769  hypothetical protein  25.42 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1351  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.99 
 
 		 324 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.367419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  29.63 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0864  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  25.36 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.847217  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.05 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0765  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.43 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3258  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.43 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.17 
 
 		 354 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0923  hypothetical protein  25.87 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.77 
 
 		 266 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1558  putative heat shock protein  28.85 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0443108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.82 
 
 		 282 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.57 
 
 		 478 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  28.57 
 
 		 478 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  27.91 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.77 
 
 		 234 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52290  hypothetical protein  26.77 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.378524 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3361  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.55 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3641  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.68 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3548  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.58 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3670  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.27 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.141959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3479  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.27 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  27.91 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.76 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.81 
 
 		 305 aa  48.5  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4760  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  23.61 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0221  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.2 
 
 		 484 aa  48.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.057348  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0388  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.97 
 
 		 242 aa  47.4  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.07 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  31.03 
 
 		 269 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.33 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0590  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.69 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.927794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4523  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.1 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207196  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2782  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.01 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.3452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  29.2 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3124  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.1 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000058993  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.32 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1135  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.89 
 
 		 234 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.566591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.81 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2405  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.19 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437003  hitchhiker  0.00230018 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4623  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.21 
 
 		 257 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179388  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0543  conserved hypothetical META domain lipoprotein  27.59 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0803  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.5 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0516  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  24.65 
 
 		 176 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.3 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.04 
 
 		 335 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2900  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.08 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.456772  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  27.36 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1689  lipoprotein, putative  27.36 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.5 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0424  hypothetical protein  28.74 
 
 		 239 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.36269 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.47 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0188  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.27 
 
 		 238 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3801  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.8 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0706  hypothetical protein  27.14 
 
 		 150 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2359  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.33 
 
 		 181 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.714187  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0275  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  23.65 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1028  putative lipoprotein  27.71 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  31.25 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0957  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  42.5 
 
 		 181 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>