35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A1466 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2266  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221661  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01363  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1616  heat-inducible protein  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1773  heat-inducible protein  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2276  heat-inducible protein  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1466  heat-inducible protein  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01351  heat-inducible protein  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2000  heat-inducible protein  99.29 
 
 		 140 aa  286  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1563  heat-inducible protein  98.57 
 
 		 140 aa  284  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1765  heat-inducible protein  69.57 
 
 		 136 aa  200  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0625871 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1768  heat-inducible protein  68.84 
 
 		 136 aa  199  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0151813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1828  heat-inducible protein  69.57 
 
 		 136 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1508  heat-inducible protein  68.12 
 
 		 136 aa  197  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1691  heat-inducible protein  68.84 
 
 		 136 aa  195  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.797199  hitchhiker  0.00277177 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2134  heat-inducible protein  64.23 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.567559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1807  heat-inducible protein  45.75 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2211  heat-inducible protein  45.75 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.27688 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1917  heat-inducible protein  45.75 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2601  heat-inducible protein  46.1 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1268  heat shock protein HslJ  33.1 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000183655  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02669  hypothetical protein  31.25 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003792  heat shock protein HslJ  31.03 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000159287  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2085  heat shock protein  31.76 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0202  heat shock protein HslJ  27.01 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2767  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.77 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795518  normal  0.509159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.83 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  27.2 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0847  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.67 
 
 		 144 aa  43.9  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.687312 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.34 
 
 		 234 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.17 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0107  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.61 
 
 		 275 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1135  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.69 
 
 		 234 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.566591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1351  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.93 
 
 		 324 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.367419 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.75 
 
 		 251 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.75 
 
 		 251 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>