55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0202 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0202  heat shock protein HslJ  100 
 
 
152 aa  311  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1268  heat shock protein HslJ  38.14 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000183655  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02669  hypothetical protein  41.58 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2085  heat shock protein  37.74 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003792  heat shock protein HslJ  33.33 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000159287  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2601  heat-inducible protein  23.65 
 
 
142 aa  60.8  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  43.33 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1917  heat-inducible protein  25.35 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2211  heat-inducible protein  25.35 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.27688 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  28.76 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1807  heat-inducible protein  25.35 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1563  heat-inducible protein  27.74 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1616  heat-inducible protein  27.01 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1773  heat-inducible protein  27.01 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2276  heat-inducible protein  27.01 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1466  heat-inducible protein  27.01 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01363  hypothetical protein  27.01 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2266  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.01 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00221661  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01351  heat-inducible protein  27.01 
 
 
140 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2000  heat-inducible protein  27.01 
 
 
140 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1828  heat-inducible protein  26.09 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1691  heat-inducible protein  26.09 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.797199  hitchhiker  0.00277177 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1508  heat-inducible protein  27.18 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1768  heat-inducible protein  27.18 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0151813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1765  heat-inducible protein  27.18 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0625871 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0923  hypothetical protein  27.96 
 
 
138 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2134  heat-inducible protein  28.07 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.567559  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.53 
 
 
221 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1244  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.06 
 
 
183 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0776  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.96 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3361  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.88 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3258  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.88 
 
 
138 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3302  hypothetical protein  33.77 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0761077  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0765  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.88 
 
 
138 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  30.86 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  23.78 
 
 
145 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0864  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  24.73 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.847217  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.08 
 
 
351 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  23.97 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0641  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.6 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0863  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  24.73 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52290  hypothetical protein  30.56 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.378524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.43 
 
 
273 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3670  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.51 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.141959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3479  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.51 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3548  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.51 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0769  hypothetical protein  24.51 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1558  putative heat shock protein  29.13 
 
 
170 aa  43.9  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0443108  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2767  hypothetical protein  21.74 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  26.37 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.4 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  25.81 
 
 
234 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  25.23 
 
 
281 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  24.16 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0744  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  21.74 
 
 
137 aa  40.4  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>