102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1727 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  100 
 
 
132 aa  274  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  63.64 
 
 
134 aa  184  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  63.28 
 
 
143 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  61.36 
 
 
134 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  61.36 
 
 
134 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  62.6 
 
 
134 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  60.77 
 
 
135 aa  167  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1689  lipoprotein, putative  57.89 
 
 
135 aa  164  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52290  hypothetical protein  54.76 
 
 
135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.378524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  53.38 
 
 
135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0863  protein of unknown function DUF306, MetA and HslJ  39.02 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0776  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.12 
 
 
137 aa  85.9  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0769  hypothetical protein  36.44 
 
 
138 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  41.51 
 
 
351 aa  82.8  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3548  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.59 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3670  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.59 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.141959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3479  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.59 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2767  hypothetical protein  37.01 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0864  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.35 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.847217  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  38.26 
 
 
325 aa  80.5  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0867  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.86 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3361  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.09 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.98 
 
 
241 aa  77.4  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0765  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.35 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3258  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.35 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  43.59 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0641  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.15 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0744  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.52 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  31.4 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0923  hypothetical protein  33.93 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.15 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.21 
 
 
267 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  37.5 
 
 
267 aa  70.9  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  44 
 
 
524 aa  68.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2944  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.72 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  34.34 
 
 
297 aa  67.8  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.82 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.37 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1558  putative heat shock protein  36.54 
 
 
170 aa  64.3  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0443108  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  36.14 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.61 
 
 
397 aa  61.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.04 
 
 
279 aa  60.5  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  41.43 
 
 
165 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02640  probable secreted protein containing HslJ-like protein  31.07 
 
 
274 aa  60.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.08 
 
 
251 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.08 
 
 
251 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0590  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.2 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.927794 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.88 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0612  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.24 
 
 
263 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.19 
 
 
279 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  33.33 
 
 
281 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.23 
 
 
282 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  38.71 
 
 
206 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04470  hypothetical protein  28.03 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.1707  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40.28 
 
 
197 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2767  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.41 
 
 
151 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795518  normal  0.509159 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0915  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.77 
 
 
167 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.649239 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0975  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.77 
 
 
167 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.790791  normal  0.0941281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0939  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.77 
 
 
167 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.104355  normal  0.45833 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1028  putative lipoprotein  27.94 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.29 
 
 
204 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1135  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36 
 
 
234 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.566591  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003792  heat shock protein HslJ  42 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000159287  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  40 
 
 
187 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0202  heat shock protein HslJ  26.97 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.04 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0760  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.23 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196794  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1923  hypothetical protein  38.18 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.87534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1348  hypothetical protein  38.18 
 
 
224 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1033  hypothetical protein  38.18 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.365055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0834  hypothetical protein  38.18 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.34 
 
 
283 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1186  hypothetical protein  38.18 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1194  hypothetical protein  38.18 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0316  hypothetical protein  38.18 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0516  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.33 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.48 
 
 
354 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.17 
 
 
365 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.33 
 
 
181 aa  42  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2359  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  41.82 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.714187  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  38.75 
 
 
305 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0974  putative lipoprotein  27.5 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0275  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.31 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1268  heat shock protein HslJ  28.87 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000183655  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40 
 
 
181 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.57 
 
 
478 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  34.57 
 
 
478 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3641  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.73 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3658  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.33 
 
 
171 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1244  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.62 
 
 
183 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02669  hypothetical protein  42.86 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.4 
 
 
335 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0603  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40.74 
 
 
220 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112924  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2403  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40 
 
 
283 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501935  hitchhiker  0.00570797 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  40 
 
 
181 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2320  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  40 
 
 
181 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1173  putative lipoprotein  27.5 
 
 
144 aa  40.8  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.891914  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2343  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40 
 
 
181 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0123815 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>