63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3302 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3302  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  366  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0761077  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1244  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  91.8 
 
 
183 aa  342  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  62.29 
 
 
197 aa  216  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2343  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  68.79 
 
 
181 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2320  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  68.79 
 
 
181 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  68.79 
 
 
181 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0957  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  63.79 
 
 
181 aa  203  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  68.09 
 
 
181 aa  203  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  66.43 
 
 
181 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2359  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  67.13 
 
 
181 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.714187  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1348  hypothetical protein  58.43 
 
 
224 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  60.24 
 
 
187 aa  191  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1186  hypothetical protein  58.43 
 
 
182 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323907  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0834  hypothetical protein  58.43 
 
 
182 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1194  hypothetical protein  58.43 
 
 
182 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1923  hypothetical protein  58.43 
 
 
182 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.87534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0316  hypothetical protein  58.43 
 
 
182 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1033  hypothetical protein  58.43 
 
 
182 aa  191  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.365055  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  35.34 
 
 
269 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  39.66 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  34.56 
 
 
157 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  49.25 
 
 
266 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32 
 
 
204 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  34.44 
 
 
281 aa  53.9  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0516  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.68 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.24 
 
 
282 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0603  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.79 
 
 
220 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112924  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.23 
 
 
221 aa  52.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0644  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.33 
 
 
226 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.143261 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.16 
 
 
165 aa  51.2  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.59 
 
 
335 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  48.28 
 
 
354 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.26 
 
 
305 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02669  hypothetical protein  29.09 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2767  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.48 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.795518  normal  0.509159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0694  hypothetical protein  31.58 
 
 
246 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00754314  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.77 
 
 
251 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.77 
 
 
251 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0847  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.11 
 
 
144 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.687312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  39.68 
 
 
134 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.61 
 
 
153 aa  47.8  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3124  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.97 
 
 
143 aa  47.8  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000058993  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0202  heat shock protein HslJ  33.77 
 
 
152 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003792  heat shock protein HslJ  27.27 
 
 
148 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000159287  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  35.44 
 
 
135 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.83 
 
 
134 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3641  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.23 
 
 
147 aa  45.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.83 
 
 
134 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.83 
 
 
134 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40.74 
 
 
279 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.87 
 
 
273 aa  44.7  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.52 
 
 
365 aa  44.3  0.0009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3439  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.07 
 
 
258 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  31.58 
 
 
135 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.68 
 
 
351 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52290  hypothetical protein  34.18 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.378524 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.5 
 
 
148 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  38.16 
 
 
143 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1689  lipoprotein, putative  30.26 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.07 
 
 
524 aa  42.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.04 
 
 
126 aa  42.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1268  heat shock protein HslJ  29.23 
 
 
147 aa  41.2  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000183655  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.09 
 
 
234 aa  40.8  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>