48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0694 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0694  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00754314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0603  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  70.73 
 
 		 220 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0644  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  69.11 
 
 		 226 aa  294  8e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.143261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  49.35 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  46.85 
 
 		 269 aa  131  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  33.55 
 
 		 187 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0957  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.33 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1923  hypothetical protein  32.26 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.87534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0316  hypothetical protein  32.26 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1033  hypothetical protein  32.26 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.365055  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1194  hypothetical protein  32.26 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0834  hypothetical protein  32.26 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1186  hypothetical protein  32.26 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323907  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1348  hypothetical protein  32.26 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0516  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.43 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1286  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.3 
 
 		 154 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.246125  normal  0.28961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2359  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.67 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.714187  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32 
 
 		 181 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1244  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.08 
 
 		 183 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3302  hypothetical protein  29.08 
 
 		 179 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0761077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2343  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.37 
 
 		 181 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40 
 
 		 165 aa  53.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2320  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.37 
 
 		 181 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.37 
 
 		 181 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.07 
 
 		 181 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.78 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.34 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  42.86 
 
 		 335 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.16 
 
 		 150 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.01 
 
 		 351 aa  46.6  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.58 
 
 		 151 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0847  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.33 
 
 		 144 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.687312 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  44.68 
 
 		 354 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  35.14 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0543  conserved hypothetical META domain lipoprotein  31.58 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40 
 
 		 134 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40 
 
 		 134 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  40 
 
 		 134 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.29 
 
 		 365 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1689  lipoprotein, putative  35.53 
 
 		 135 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2944  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  43.4 
 
 		 154 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.21 
 
 		 241 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  40.26 
 
 		 148 aa  43.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  40.74 
 
 		 135 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.03 
 
 		 282 aa  42.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  39.62 
 
 		 134 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.15 
 
 		 305 aa  42  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>