66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2239 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  100 
 
 
181 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2359  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  98.34 
 
 
181 aa  363  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.714187  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2343  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  92.27 
 
 
181 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2320  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  92.27 
 
 
181 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  92.27 
 
 
181 aa  318  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  90.61 
 
 
181 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0957  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  88.83 
 
 
181 aa  291  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1348  hypothetical protein  71.67 
 
 
224 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1923  hypothetical protein  71.67 
 
 
182 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.87534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0316  hypothetical protein  71.67 
 
 
182 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1194  hypothetical protein  71.67 
 
 
182 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1186  hypothetical protein  71.67 
 
 
182 aa  250  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323907  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0834  hypothetical protein  71.67 
 
 
182 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1033  hypothetical protein  71.67 
 
 
182 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.365055  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  72.35 
 
 
187 aa  242  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3302  hypothetical protein  62.07 
 
 
179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0761077  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1244  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  65.41 
 
 
183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  63.09 
 
 
197 aa  193  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  40.97 
 
 
269 aa  89  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  43.48 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0516  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.98 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.29 
 
 
251 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.29 
 
 
251 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.11 
 
 
282 aa  58.2  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0603  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.03 
 
 
220 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112924  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  35.87 
 
 
281 aa  56.2  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3641  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.45 
 
 
147 aa  55.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0644  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.05 
 
 
226 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.143261 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1286  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.03 
 
 
154 aa  54.3  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.246125  normal  0.28961 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.43 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  33.83 
 
 
157 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  45.9 
 
 
266 aa  51.6  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.17 
 
 
279 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.58 
 
 
305 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0694  hypothetical protein  34.65 
 
 
246 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00754314  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0590  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  50 
 
 
140 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.927794 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.74 
 
 
234 aa  49.7  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0847  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.7 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.687312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  48.15 
 
 
221 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.33 
 
 
204 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.81 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.63 
 
 
354 aa  48.9  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.71 
 
 
279 aa  48.9  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.21 
 
 
152 aa  48.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.08 
 
 
365 aa  47.8  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04470  hypothetical protein  36.96 
 
 
137 aa  47.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.1707  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3124  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.5 
 
 
143 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000058993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4226  hypothetical protein  31.86 
 
 
134 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.294612  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3700  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00210356  hitchhiker  0.00102012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.7 
 
 
335 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  37.14 
 
 
246 aa  44.7  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.61 
 
 
145 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1135  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.71 
 
 
234 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.566591  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.06 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4585  hypothetical protein  34.38 
 
 
135 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.96 
 
 
351 aa  43.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2275  hypothetical protein  27.59 
 
 
172 aa  42  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  40 
 
 
132 aa  42  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1689  lipoprotein, putative  30.77 
 
 
135 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.313858  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.9 
 
 
134 aa  42  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.31 
 
 
278 aa  41.2  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1249  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.9 
 
 
134 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000125713 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02640  probable secreted protein containing HslJ-like protein  28.37 
 
 
274 aa  40.8  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4070  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.9 
 
 
134 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.618195  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1647  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.114343  normal  0.330548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>