72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2713 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  551  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  79.76 
 
 
275 aa  424  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0603  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  47.4 
 
 
220 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112924  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0644  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  47.4 
 
 
226 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.143261 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0694  hypothetical protein  46.85 
 
 
246 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00754314  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1816  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.62 
 
 
242 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.2 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.2 
 
 
251 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1408  hypothetical protein  41.96 
 
 
126 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4163  hypothetical protein  52.56 
 
 
130 aa  91.3  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.739708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4373  hypothetical protein  52.33 
 
 
126 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5831  hypothetical protein  52.56 
 
 
126 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0377295  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4472  hypothetical protein  52.56 
 
 
126 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0695471  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3896  hypothetical protein  52.56 
 
 
126 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.612405  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3909  hypothetical protein  52.56 
 
 
114 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1948  hypothetical protein  41.57 
 
 
93 aa  89.4  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.017196 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0742  hypothetical protein  49.33 
 
 
148 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.865339  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1015  proteinase inhibitor I1 Kazal  44.58 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0920  hypothetical protein  48 
 
 
151 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2692  hypothetical protein  48 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2466  hypothetical protein  48 
 
 
154 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2385  hypothetical protein  48.61 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  40.48 
 
 
187 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0754  hypothetical protein  48 
 
 
148 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.137225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0957  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.73 
 
 
181 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1244  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.3 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  40.8 
 
 
181 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1194  hypothetical protein  40.16 
 
 
182 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0316  hypothetical protein  40.16 
 
 
182 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1923  hypothetical protein  40.16 
 
 
182 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.87534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1348  hypothetical protein  40.16 
 
 
224 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0834  hypothetical protein  40.16 
 
 
182 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1033  hypothetical protein  40.16 
 
 
182 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.365055  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1186  hypothetical protein  40.16 
 
 
182 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323907  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2320  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  39.16 
 
 
181 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  39.16 
 
 
181 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2343  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.16 
 
 
181 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3302  hypothetical protein  35.34 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0761077  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  42.2 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2359  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  42.2 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.714187  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0516  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.72 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.98 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1286  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.54 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.246125  normal  0.28961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0107  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.56 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2483  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.41 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.897758  normal  0.934589 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.24 
 
 
365 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5534  hypothetical protein  36.11 
 
 
193 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.28 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.75 
 
 
148 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.65 
 
 
221 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40.82 
 
 
354 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.11 
 
 
335 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0543  conserved hypothetical META domain lipoprotein  25.52 
 
 
137 aa  50.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0612  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  39.62 
 
 
263 aa  49.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.09 
 
 
279 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03570  domain of unknown function (306) family  23.27 
 
 
265 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.101007  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.41 
 
 
234 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.01 
 
 
146 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.36 
 
 
145 aa  48.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.99 
 
 
204 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3124  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.03 
 
 
143 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000058993  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1434  hypothetical protein  25.96 
 
 
284 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  31.03 
 
 
154 aa  47  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3712  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  46.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.750791  hitchhiker  0.0000649397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.7 
 
 
150 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1135  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.14 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.566591  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0803  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.34 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  48.98 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.69 
 
 
126 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.66 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.66 
 
 
397 aa  42.7  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3589  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  44.68 
 
 
287 aa  42  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>