50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1286 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1286  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  100 
 
 		 154 aa  318  1.9999999999999998e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.246125  normal  0.28961 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0516  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  85.33 
 
 		 176 aa  273  8e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  30.54 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  31.91 
 
 		 275 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  30.71 
 
 		 281 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  29.13 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1923  hypothetical protein  29.23 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.87534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1033  hypothetical protein  29.23 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.365055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0834  hypothetical protein  29.23 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1194  hypothetical protein  29.23 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0316  hypothetical protein  29.23 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1186  hypothetical protein  29.23 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323907  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0603  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.41 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0694  hypothetical protein  30.3 
 
 		 246 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00754314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1348  hypothetical protein  29.23 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0644  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.85 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.143261 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.83 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.23 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0957  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.68 
 
 		 181 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.64 
 
 		 251 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.38 
 
 		 397 aa  51.6  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2359  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.13 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.714187  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.64 
 
 		 251 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.13 
 
 		 181 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.13 
 
 		 181 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.61 
 
 		 204 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2320  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.35 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.35 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2343  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.35 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  22.58 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.22 
 
 		 197 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0847  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.25 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.687312 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.1 
 
 		 273 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.97 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  32.65 
 
 		 478 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  23.61 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.65 
 
 		 478 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0543  conserved hypothetical META domain lipoprotein  30.14 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.17 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3439  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  26.32 
 
 		 258 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.72 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000168572  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.88 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02640  probable secreted protein containing HslJ-like protein  29.8 
 
 		 274 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1135  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.5 
 
 		 234 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.566591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.63 
 
 		 335 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  25.98 
 
 		 206 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  25.71 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0787  heat shock protein  29.41 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0351684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  24.53 
 
 		 282 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3124  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.56 
 
 		 143 aa  40.4  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000058993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>