96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0192 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  100 
 
 		 354 aa  724    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  47.89 
 
 		 365 aa  312  5.999999999999999e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  28.35 
 
 		 478 aa  119  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.35 
 
 		 478 aa  119  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0731  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.25 
 
 		 232 aa  105  9e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.675493  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3410  copper resistance lipoprotein NlpE  28.69 
 
 		 236 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0197  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.69 
 
 		 236 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0279  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.96 
 
 		 233 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.469251  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0204  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.69 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0195  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.69 
 
 		 236 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0203  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.69 
 
 		 236 aa  104  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.852847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0186  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.69 
 
 		 236 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3467  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.69 
 
 		 236 aa  104  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.451187 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00191  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.69 
 
 		 236 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320519  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00190  hypothetical protein  28.69 
 
 		 236 aa  104  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.96 
 
 		 233 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1090  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.33 
 
 		 227 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3411  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.33 
 
 		 227 aa  102  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.225422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1037  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.33 
 
 		 227 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17094  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.13 
 
 		 233 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105174  normal  0.673786 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0268  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  29.71 
 
 		 233 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0282  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  29.71 
 
 		 233 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.943806  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  42.61 
 
 		 148 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3759  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30.05 
 
 		 227 aa  93.6  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579479  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0963  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  30 
 
 		 232 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3338  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  32.34 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  38.32 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.75 
 
 		 165 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.25 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0410  hypothetical protein  34.25 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.33 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3920  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.9 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0592511  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0137  hypothetical protein  31.43 
 
 		 146 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000209855  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.62 
 
 		 126 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  28.87 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  35.21 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  27.5 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  39.22 
 
 		 197 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.47 
 
 		 397 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1244  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40 
 
 		 183 aa  52.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.25 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0603  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.1 
 
 		 220 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0644  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  46.94 
 
 		 226 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.143261 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  29.17 
 
 		 154 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.4 
 
 		 152 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.78 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0957  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.64 
 
 		 181 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4623  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.12 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179388  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2359  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.62 
 
 		 181 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.714187  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3439  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.91 
 
 		 258 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  40.82 
 
 		 269 aa  50.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3302  hypothetical protein  48.28 
 
 		 179 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0761077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  42 
 
 		 275 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.64 
 
 		 181 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.23 
 
 		 234 aa  49.7  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2343  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.64 
 
 		 181 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2320  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.64 
 
 		 181 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0787  heat shock protein  34.19 
 
 		 166 aa  49.3  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0351684 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.64 
 
 		 181 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.63 
 
 		 181 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2944  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.21 
 
 		 154 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.06 
 
 		 279 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.97 
 
 		 146 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3143  hypothetical protein  29.46 
 
 		 203 aa  49.3  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0221  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.93 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.057348  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1389  lipoprotein  31.31 
 
 		 168 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.14974  hitchhiker  0.000530536 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1336  copper resistance lipoprotein NlpE  31.31 
 
 		 170 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.534526  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.2 
 
 		 150 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1401  copper resistance lipoprotein NlpE  31.31 
 
 		 168 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0735011 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.61 
 
 		 267 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.2 
 
 		 274 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.2 
 
 		 280 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3163  lipoprotein  31.31 
 
 		 150 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.3 
 
 		 273 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  23.36 
 
 		 282 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  30.48 
 
 		 138 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.97 
 
 		 151 aa  46.2  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3540  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  42.42 
 
 		 325 aa  46.2  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2234  uncharacterized lipoprotein NlpE involved in copper resistance  31.91 
 
 		 202 aa  46.2  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.24 
 
 		 241 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0694  hypothetical protein  44.68 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00754314  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  24.48 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0207  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.77 
 
 		 153 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000688  lipoprotein  31 
 
 		 178 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.222485  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3124  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.18 
 
 		 143 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000058993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4523  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35 
 
 		 139 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207196  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0275  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.63 
 
 		 145 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1083  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.22 
 
 		 279 aa  43.9  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.69 
 
 		 145 aa  43.5  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  23.96 
 
 		 297 aa  43.5  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.48 
 
 		 132 aa  43.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0516  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  21.67 
 
 		 176 aa  43.1  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06567  hypothetical protein  32 
 
 		 169 aa  43.1  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3563  lipoprotein  32 
 
 		 147 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.829032  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.07 
 
 		 524 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1209  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.82 
 
 		 134 aa  42.7  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>