56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0963 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0963  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  100 
 
 		 232 aa  485  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3338  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  79.48 
 
 		 229 aa  395  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3411  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  54.59 
 
 		 227 aa  265  5.999999999999999e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.225422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1090  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  54.59 
 
 		 227 aa  265  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1037  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  54.59 
 
 		 227 aa  265  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17094  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3759  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  57.21 
 
 		 227 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579479  normal  0.0900317 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3410  copper resistance lipoprotein NlpE  50.45 
 
 		 236 aa  231  6e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3467  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  50.45 
 
 		 236 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.451187 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0197  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  50 
 
 		 236 aa  230  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0195  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  50 
 
 		 236 aa  230  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0203  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  50 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.852847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0731  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  48.73 
 
 		 232 aa  228  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.675493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0186  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  50 
 
 		 236 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00190  hypothetical protein  50 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00191  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  50 
 
 		 236 aa  228  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0204  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  49.11 
 
 		 236 aa  228  8e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  49.55 
 
 		 233 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105174  normal  0.673786 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0268  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  49.55 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0279  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  49.55 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.469251  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0282  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  49.55 
 
 		 233 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.943806  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  49.11 
 
 		 233 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3143  hypothetical protein  58.21 
 
 		 203 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2958  hypothetical protein  41.57 
 
 		 171 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30 
 
 		 354 aa  91.7  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.6 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000688  lipoprotein  35.05 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.222485  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1548  lipoprotein  40.66 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000337346  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06567  hypothetical protein  42.68 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1432  putative lipoprotein  31.78 
 
 		 143 aa  58.2  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.384033  normal  0.561285 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0410  hypothetical protein  31.13 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1624  copper homeostasis protein CutF  36.47 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.041939  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1524  hypothetical protein  34.12 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0802  copper homeostasis protein CutF  27.1 
 
 		 124 aa  53.9  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000203598  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3163  lipoprotein  35.56 
 
 		 150 aa  52.8  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2234  uncharacterized lipoprotein NlpE involved in copper resistance  34.41 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2266  hypothetical protein  33.06 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1336  copper resistance lipoprotein NlpE  33.33 
 
 		 170 aa  52  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.534526  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1401  copper resistance lipoprotein NlpE  33.33 
 
 		 168 aa  52  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0735011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1389  lipoprotein  34.48 
 
 		 168 aa  52  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.14974  hitchhiker  0.000530536 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  32.97 
 
 		 278 aa  52  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3687  lipoprotein  31.82 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2886  lipoprotein  35.56 
 
 		 148 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1490  copper resistance lipoprotein NlpE  35.56 
 
 		 149 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.136329  normal  0.226076 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3015  lipoprotein  35.56 
 
 		 149 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2526  copper resistance lipoprotein NlpE  32.95 
 
 		 148 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2869  lipoprotein  33.33 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3071  lipoprotein  31.37 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0509  hypothetical protein  33.59 
 
 		 152 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2819  lipoprotein  29.13 
 
 		 149 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.271135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3215  lipoprotein, putative  29.13 
 
 		 149 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3563  lipoprotein  31.03 
 
 		 147 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.829032  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1474  hypothetical protein  32.08 
 
 		 241 aa  45.4  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0773406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1523  hypothetical protein  31.96 
 
 		 401 aa  45.4  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03210  lipoprotein  32.67 
 
 		 142 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1626  hypothetical protein  32.1 
 
 		 402 aa  43.5  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00390674  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0041  hypothetical protein  28.57 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>