46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3071 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3071  lipoprotein  100 
 
 		 169 aa  341  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2234  uncharacterized lipoprotein NlpE involved in copper resistance  42.2 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1389  lipoprotein  43.79 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.14974  hitchhiker  0.000530536 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3163  lipoprotein  42.31 
 
 		 150 aa  123  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1401  copper resistance lipoprotein NlpE  43.2 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0735011 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1336  copper resistance lipoprotein NlpE  43.2 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.534526  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3986  copper resistance lipoprotein NlpE  41.28 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.773846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3687  lipoprotein  38.82 
 
 		 172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1490  copper resistance lipoprotein NlpE  41.92 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.136329  normal  0.226076 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2869  lipoprotein  41.32 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3015  lipoprotein  41.32 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2886  lipoprotein  41.32 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2526  copper resistance lipoprotein NlpE  40.72 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06567  hypothetical protein  39.47 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000688  lipoprotein  34.04 
 
 		 178 aa  97.4  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.222485  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.65 
 
 		 278 aa  97.1  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1548  lipoprotein  42.74 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000337346  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3563  lipoprotein  38.66 
 
 		 147 aa  90.5  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.829032  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3215  lipoprotein, putative  34.56 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2819  lipoprotein  34.56 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.271135 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2757  hypothetical protein  31.5 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03210  lipoprotein  30.25 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1432  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.384033  normal  0.561285 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3411  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  33.02 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.225422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1090  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  33.02 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0204  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.57 
 
 		 236 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1037  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  33.02 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0410  hypothetical protein  42.55 
 
 		 192 aa  48.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1523  hypothetical protein  27.16 
 
 		 401 aa  47.8  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00191  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.78 
 
 		 236 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320519  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00190  hypothetical protein  27.78 
 
 		 236 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0203  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.78 
 
 		 236 aa  47.8  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.852847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0197  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.78 
 
 		 236 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3410  copper resistance lipoprotein NlpE  27.78 
 
 		 236 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0186  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.78 
 
 		 236 aa  47.4  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3467  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.78 
 
 		 236 aa  47.4  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.451187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0963  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.37 
 
 		 232 aa  47.4  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0195  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.78 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0731  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  35.29 
 
 		 232 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.675493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3338  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.44 
 
 		 229 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0268  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.27 
 
 		 233 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0282  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.27 
 
 		 233 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.943806  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.27 
 
 		 233 aa  42  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105174  normal  0.673786 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1624  copper homeostasis protein CutF  22.37 
 
 		 144 aa  41.6  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.041939  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.27 
 
 		 233 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0279  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.27 
 
 		 233 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.469251  normal  0.756281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>